RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.39□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.39□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.38□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAL2Q16559 108 aa5.38□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00575Q6W349 94 aa5.38□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMIM6P0DI80 62 aa5.37□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 Q6ZQY7 126 aa5.37□□□□□ -1.55
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.37□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.37□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRIAP1O43715 76 aa5.36□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.36□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.35□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.34□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 hADV29S1A0JD25 119 aa5.34□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.34□□□□□ -1.55
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLEC2BQ92478 149 aa5.34□□□□□ -1.55
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTAG1AP78358 180 aa5.32□□□□□ -1.56
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VAMP3Q15836 100 aa5.32□□□□□ -1.56
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.32□□□□□ -1.56
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.31□□□□□ -1.56
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPINK1P00995 79 aa5.29□□□□□ -1.56
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.28□□□□□ -1.56
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGFL1Q6UW32 110 aa5.27□□□□□ -1.57
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 F8WEM9 126 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BATFQ16520 125 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.25□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSTD3H0UI37 97 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 M0R143 59 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TPRXLQ17RH7 258 aa5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD164Q04900 197 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.22□□□□□ -1.57
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LIMD2Q9BT23 127 aa5.22□□□□□ -1.57
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A1B0GX51 115 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LST1O00453 97 aa5.21□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FABP2P12104 132 aa5.21□□□□□ -1.58
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDIP1Q9H305 208 aa5.2□□□□□ -1.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C9orf92A6NGG3 77 aa5.19□□□□□ -1.58
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A087WSZ3 146 aa5.14□□□□□ -1.59
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.12□□□□□ -1.59
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.1□□□□□ -1.59
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TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.09□□□□□ -1.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCKP06307 115 aa5.09□□□□□ -1.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VPS25Q9BRG1 176 aa5.09□□□□□ -1.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 H3BQ85 93 aa5.07□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.07□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PCOTHQ58A44 107 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIGMAR1Q99720 223 aa5.06□□□□□ -1.6
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.06□□□□□ -1.6
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