RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 LINC00310P59036 64 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 PYY3Q5JQD4 70 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 Q96NJ1 140 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.49□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 TSTD3H0UI37 97 aa7.48□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 A0A0J9YXY3 114 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GWB2 263 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 TRGC2P03986 189 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-204ENST00000436289 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.46□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 F8WEM9 126 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 NEBP20929 6669 aa7.45□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 A4D1N5 150 aa7.44□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 A8MUU9 505 aa7.44□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 H0Y8G0 127 aa7.44□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 Q6JHZ5 121 aa7.44□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.44□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 ZNF815PA8K554 130 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 DPM2O94777 84 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 FABP4P15090 132 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 IGFL1Q6UW32 110 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 HSBP1O75506 76 aa7.42□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 TIMM17BO60830 172 aa7.41□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 SERF1AO75920 110 aa7.41□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 C14orf144Q96I85 54 aa7.41□□□□□ -1.22
NELFE-204ENST00000436289 LST1O00453 97 aa7.39□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 LEPROTL1O95214 131 aa7.39□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 IGKCP01834 107 aa7.39□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 CLEC2BQ92478 149 aa7.39□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 E9PLD3 99 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 LITAFQ99732 161 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.36□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-204ENST00000436289 MTURNQ8N3F0 131 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 COPS9Q8WXC6 57 aa7.33□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GV90 55 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 M0R143 59 aa7.32□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.31□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.31□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 A6NDN8 102 aa7.3□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 SCGB1D1O95968 90 aa7.3□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 HRES1P13985 223 aa7.29□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZVH6 145 aa7.28□□□□□ -1.24
NELFE-204ENST00000436289 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 A8MWP4 228 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 VAMP3Q15836 100 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.26□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.25□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 IFITM1P13164 125 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 LINC01545Q5VT33 79 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 VAMP8Q9BV40 100 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZQY7 126 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFE-204ENST00000436289 hADV29S1A0JD25 119 aa7.21□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.21□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 LINC00575Q6W349 94 aa7.21□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.21□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 PET117Q6UWS5 81 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 DLEU1O43261 78 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 C3orf79P0CE67 100 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 DSCR10P59022 87 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 LINC00313P59037 77 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 KRTDAPP60985 99 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 TEN1Q86WV5 123 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.16□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 SPATA45Q537H7 98 aa7.15□□□□□ -1.26
NELFE-204ENST00000436289 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.13□□□□□ -1.27
NELFE-204ENST00000436289 H3BUT2 72 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFE-204ENST00000436289 A0A087WSZ3 146 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFE-204ENST00000436289 SIGMAR1Q99720 223 aa7.09□□□□□ -1.27
NELFE-204ENST00000436289 GHRHP01286 108 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 BATFQ16520 125 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 ATOH7Q8N100 152 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 A6NN06 94 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP5-9P26371 169 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 UBE2V1Q13404 147 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 SPINK7P58062 85 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.04□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 IGKV4-1P06312 121 aa7.03□□□□□ -1.28
NELFE-204ENST00000436289 SNCGO76070 127 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-204ENST00000436289 MDN1Q9NU22 5596 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-204ENST00000436289 KMT2DO14686 5537 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-204ENST00000436289 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms