RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 PRR15Q8IV56 129 aa9.47□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 IGFL1Q6UW32 110 aa9.46□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 PRR4Q16378 134 aa9.45□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 V9GYY9 64 aa9.45□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0G2JQZ4 141 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PNN7 141 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 MP68P56378 58 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.43□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.42□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 PSPHP1O15172 72 aa9.42□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.41□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.41□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WSZ3 146 aa9.41□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00208Q96KT6 92 aa9.38□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 B9D2Q9BPU9 175 aa9.38□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 PRLHP81277 87 aa9.37□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.36□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 H3BPC8 53 aa9.35□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.34□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 H0Y9P7 68 aa9.34□□□□□ -0.91
TOP3B-206ENST00000436282 A8MUN3 132 aa9.34□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 CASC2Q6XLA1 102 aa9.34□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2AP49459 152 aa9.32□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.32□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.31□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 PMAIP1Q13794 54 aa9.31□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 SEC61GP60059 68 aa9.31□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.31□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 A0A096LNI7 61 aa9.3□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf90A8MZG2 172 aa9.3□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 Q5VV11 94 aa9.3□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 A8MWP4 228 aa9.29□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 LYSTQ99698 3801 aa9.28□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.27□□□□□ -0.92
TOP3B-206ENST00000436282 COL7A1Q02388 2944 aa9.27□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 TENM2Q9NT68 2774 aa9.26□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR1BP22528 89 aa9.26□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.26□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 LIMD2Q9BT23 127 aa9.26□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.24□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 MDFIQ99750 246 aa9.23□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 H0Y9J4 135 aa9.22□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 APLNQ9ULZ1 77 aa9.21□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.21□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 A8MU10 97 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 CHTF8P0CG12 524 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 PRR15LQ9BU68 103 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.18□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 COA5Q86WW8 74 aa9.17□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH9Q9NYC9 4486 aa9.16□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 Q75L30 129 aa9.14□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.14□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 C14orf177Q52M58 125 aa9.11□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.11□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.11□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.1□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 MOBPQ13875 183 aa9.1□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 PCOTHQ58A44 107 aa9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 Q96NJ1 140 aa9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 A6NED7 52 aa9.08□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 CD164Q04900 197 aa9.08□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 LCA10Q71F78 164 aa9.08□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.07□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZR54 194 aa9.07□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.07□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.06□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.06□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 PANO1I0J062 215 aa9.05□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 NUPR2A6NF83 97 aa9.05□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.04□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.04□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.02□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.02□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.02□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GVX0 72 aa8.99□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFS5O43920 106 aa8.99□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 A6NN06 94 aa8.98□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.98□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 HRES1P13985 223 aa8.97□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00483Q53H64 154 aa8.97□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 CDK2AP2O75956 126 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms