RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 PRR15Q8IV56 129 aa9.47□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 IGFL1Q6UW32 110 aa9.46□□□□□ -0.89
TOP3B-206ENST00000436282 PRR4Q16378 134 aa9.45□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 V9GYY9 64 aa9.45□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH3Q8TD57 4116 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0G2JQZ4 141 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PNN7 141 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 MP68P56378 58 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.44□□□□□ -0.9
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.43□□□□□ -0.9
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TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.32□□□□□ -0.92
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TOP3B-206ENST00000436282 COL7A1Q02388 2944 aa9.27□□□□□ -0.93
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TOP3B-206ENST00000436282 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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TOP3B-206ENST00000436282 H0Y9J4 135 aa9.22□□□□□ -0.93
TOP3B-206ENST00000436282 APLNQ9ULZ1 77 aa9.21□□□□□ -0.93
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TOP3B-206ENST00000436282 A8MU10 97 aa9.2□□□□□ -0.94
TOP3B-206ENST00000436282 CHTF8P0CG12 524 aa9.2□□□□□ -0.94
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TOP3B-206ENST00000436282 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.11□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.11□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.1□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 MOBPQ13875 183 aa9.1□□□□□ -0.95
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TOP3B-206ENST00000436282 PCOTHQ58A44 107 aa9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 Q96NJ1 140 aa9.09□□□□□ -0.95
TOP3B-206ENST00000436282 A6NED7 52 aa9.08□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 CD164Q04900 197 aa9.08□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 LCA10Q71F78 164 aa9.08□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.07□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZR54 194 aa9.07□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.07□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.06□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.06□□□□□ -0.96
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TOP3B-206ENST00000436282 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.04□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.04□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.02□□□□□ -0.96
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.02□□□□□ -0.97
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TOP3B-206ENST00000436282 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9□□□□□ -0.97
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TOP3B-206ENST00000436282 NDUFS5O43920 106 aa8.99□□□□□ -0.97
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TOP3B-206ENST00000436282 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.98□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 HRES1P13985 223 aa8.97□□□□□ -0.97
TOP3B-206ENST00000436282 LINC00483Q53H64 154 aa8.97□□□□□ -0.97
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TOP3B-206ENST00000436282 CDK2AP2O75956 126 aa8.95□□□□□ -0.98
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