RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.07□□□□□ -1.6
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.92□□□□□ -1.62
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.92□□□□□ -1.62
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.91□□□□□ -1.62
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A0A087WVE0 104 aa4.9□□□□□ -1.63
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.9□□□□□ -1.63
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.89□□□□□ -1.63
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.88□□□□□ -1.63
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPRR4Q96PI1 79 aa4.88□□□□□ -1.63
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.87□□□□□ -1.63
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TTC28-AS1-209ENST00000428858 MT1HL1P0DM35 61 aa4.86□□□□□ -1.63
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