RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 U3KQA8 63 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSMD3Q7Z407 3707 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 LMO7Q8WWI1 1683 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLCE1Q9P212 2302 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 APLNQ9ULZ1 77 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB130BP0DP73 79 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB130AP0DP74 79 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB109BQ30KR1 87 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 MINOS1Q5TGZ0 78 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPINK4O60575 86 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 IAPPP10997 89 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIF21BO75037 1637 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 USF3Q68DE3 2245 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 BPTFQ12830 3046 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLK9Q2XQG4 91 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 URB1O60287 2271 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGF2RP11717 2491 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 WT1-ASQ06250 92 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYCBP2O75592 4640 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUOX1Q9NRD9 1551 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAST4O15021 2626 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TENM4Q6N022 2769 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 REV3LO60673 3130 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 NDUFA1O15239 70 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TFF3Q07654 80 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TNXBP22105 4242 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 S4R3F8 94 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 H3BUA1 57 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 MROH2BQ7Z745 1585 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 BSNQ9UPA5 3926 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 LPAP08519 4548 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAH11Q96DT5 4516 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRANK1O15050 2925 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRLHP81277 87 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLTCL1P53675 1640 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 AKAP13Q12802 2813 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 AKAP6Q13023 2319 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PKD1P98161 4303 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 KMT2AQ03164 3969 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 VWFP04275 2813 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB131AP59861 70 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB106AQ8N104 65 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 KAAG1Q9UBP8 84 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 LYSTQ99698 3801 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 GCC2Q8IWJ2 1684 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSPG2P98160 4391 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 M0R2T5 61 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRM1P04553 51 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DEFB135Q30KP9 77 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAH2Q9P225 4427 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHD6Q8TD26 2715 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATRQ13535 2644 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCNX1Q96RV3 2341 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-272P-201ENST00000411028 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms