RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 HRES1P13985 223 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.72□□□□□ -0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 Q1T7F1 81 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC01554Q52M75 96 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 DSPP15924 2871 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0D9SG42 100 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMA3Q16787 3333 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0C4DFX4 3053 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.66□□□□□ -0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 LCA10Q71F78 164 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A1B0GU33 70 aa9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 LCE6AA0A183 80 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 Q5W150 140 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-1P60331 282 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 Q75L30 129 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP10-2P60368 255 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 LINC00483Q53H64 154 aa9.52□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 CSAG1Q6PB30 78 aa9.52□□□□□ -0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 SPINK7P58062 85 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 Q6ZR54 194 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 Q5VSD8 79 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 BRCA2P51587 3418 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIOO75962 3097 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 S4R3F8 94 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 PANO1I0J062 215 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 M0R2T5 61 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 DMAC1Q96GE9 116 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 ITPR2Q14571 2701 aa9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 ITPR1Q14643 2758 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 Q5XG85 94 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 FRYQ5TBA9 3013 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 FLNCQ14315 2725 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 Q5VV11 94 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 LUZP6Q538Z0 58 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A087X002 238 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 R4GN34 69 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 TACC2O95359 2948 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 OXTP01178 125 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 ATMQ13315 3056 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 HIVEP1P15822 2718 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 COL12A1Q99715 3063 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 PRAC1Q96KF2 57 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 KALRNO60229 2985 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 FRYLO94915 3013 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 M0QZ58 72 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH23Q9H251 3354 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 ROMO1P60602 79 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 TENM4Q6N022 2769 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 H3BS24 57 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 APCP25054 2843 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 REV3LO60673 3130 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 LAMA1P25391 3075 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 LRBAP50851 2863 aa8.98□□□□□ -0.97
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