RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.32□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 K7EQZ3 153 aa6.32□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.32□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 CRYGAP11844 174 aa6.31□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.31□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 STAB1Q9NY15 2570 aa6.31□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV7-43P04211 117 aa6.3□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 PCOTHQ58A44 107 aa6.3□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 hDV103S1A0JD37 113 aa6.3□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 LINC01600Q96MT4 127 aa6.3□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 K7ERS5 55 aa6.29□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1W2PNM2 257 aa6.28□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR4Q96PI1 79 aa6.28□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 FAM229AH3BQW9 127 aa6.28□□□□□ -1.4
TTPAL-202ENST00000372904 NF1P21359 2839 aa6.27□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 PRR15LQ9BU68 103 aa6.26□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 A8MWP4 228 aa6.26□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.25□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 NOTCH1P46531 2555 aa6.25□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.24□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.24□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR1AP35321 89 aa6.23□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00313P59037 77 aa6.22□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 BRK1Q8WUW1 75 aa6.22□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 A0A0U1RQV1 116 aa6.21□□□□□ -1.41
TTPAL-202ENST00000372904 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.21□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 PANO1I0J062 215 aa6.21□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.21□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 AKAP9Q99996 3911 aa6.2□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-2P60368 255 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 DSCR10P59022 87 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 IGKV2-30P06310 120 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 PRR15Q8IV56 129 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.18□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 Q96NJ1 140 aa6.18□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.17□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf195Q5TG92 126 aa6.17□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.17□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.17□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.16□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.16□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZR54 194 aa6.16□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GVX0 72 aa6.15□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.15□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP10-1P60331 282 aa6.14□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.13□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 CUBNO60494 3623 aa6.13□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.12□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 C9orf92A6NGG3 77 aa6.12□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 C8orf87E5RJ46 101 aa6.12□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.12□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 SPINK1P00995 79 aa6.11□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.1□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 LCE6AA0A183 80 aa6.09□□□□□ -1.43
TTPAL-202ENST00000372904 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.09□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 H3BPC8 53 aa6.08□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 PSPHP1O15172 72 aa6.07□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 SPRR1BP22528 89 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.05□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 KLKP1Q107X0 134 aa6.04□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 A6NED7 52 aa6.04□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.04□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 CD164Q04900 197 aa6.03□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.03□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 H7BZZ5 65 aa6.03□□□□□ -1.44
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.02□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 OCR1Q9BZK8 76 aa6.02□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00483Q53H64 154 aa6.01□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 ACYP2P14621 99 aa6.01□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.01□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 J3QL48 77 aa6□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 C4orf26Q17RF5 130 aa6□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.99□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.99□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.98□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.96□□□□□ -1.45
TTPAL-202ENST00000372904 COA5Q86WW8 74 aa5.96□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 VWFP04275 2813 aa5.95□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087X002 238 aa5.94□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 Q5VSD8 79 aa5.94□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.92□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 TENM3Q9P273 2699 aa5.91□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GU69 56 aa5.9□□□□□ -1.47
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N1X5 172 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms