RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKHD1P08F94 4074 aa4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYCNQ0VAF6 134 aa4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFAF8A1L188 74 aa4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SFTA2Q6UW10 78 aa4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.09□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.09□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H7C2G1 150 aa4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATXN8Q156A1 80 aa4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.08□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A0B4J2C4 111 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H7BZZ5 65 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZR54 194 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C14orf177Q52M58 125 aa4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A8MUN3 132 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A087WTM6 91 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COX17Q14061 63 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCA10Q71F78 164 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q8N814 137 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PKD1P98161 4303 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCE6AA0A183 80 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LST1O00453 97 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCR3O14931 201 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.04□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RTL8CO15255 209 aa4.03□□□□□ -1.76
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C20orf197Q8N268 126 aa4.02□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.02□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.02□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM168BA1KXE4 195 aa4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A096LNI7 61 aa4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KLKP1Q107X0 134 aa4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6JHZ5 121 aa4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFC1O43677 76 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TLX1NBP0CAT3 122 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBE2BP63146 152 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf163Q8N9P6 203 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q8NDZ9 215 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV2D-28P01615 120 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MP68P56378 58 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCE1O60756 84 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00313P59037 77 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COX6CP09669 75 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C16orf90A8MZG2 172 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HAMPP81172 84 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q1T7F1 81 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1B0GVX0 72 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DIRC1Q969H9 104 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RYR1P21817 5038 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A1W2PNN7 141 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 F8WEM9 126 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PANO1I0J062 215 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C22orf24Q9Y442 160 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.97□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.96□□□□□ -1.77
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.96□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A0A087WVE0 104 aa3.96□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A6NN06 94 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBE2AP49459 152 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLEC2BQ92478 149 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00167Q96N53 147 aa3.95□□□□□ -1.78
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms