RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 HAMPP81172 84 aa10.97□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.97□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.96□□□□□ -0.65
ACTB-201ENST00000331789 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
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ACTB-201ENST00000331789 SPRR1BP22528 89 aa10.96□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 Q8NBF4 154 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 IGFL1Q6UW32 110 aa10.93□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.93□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-1P60331 282 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 SCXQ7RTU7 201 aa10.91□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.91□□□□□ -0.66
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ACTB-201ENST00000331789 DNAH5Q8TE73 4624 aa10.9□□□□□ -0.66
ACTB-201ENST00000331789 SPRR4Q96PI1 79 aa10.9□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 DNAH8Q96JB1 4490 aa10.88□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 CXCL6P80162 114 aa10.88□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 PKD1P98161 4303 aa10.88□□□□□ -0.67
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF861PO60384 105 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 LCE6AA0A183 80 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 CRYGAP11844 174 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZSA8 131 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTB-201ENST00000331789 IGLV7-43P04211 117 aa10.83□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 LINC00483Q53H64 154 aa10.82□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 BPY2O14599 106 aa10.8□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.8□□□□□ -0.68
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ACTB-201ENST00000331789 Q8N9L7 120 aa10.79□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WSZ3 146 aa10.78□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 CCDC179H3BU77 68 aa10.78□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 ATOX1O00244 68 aa10.78□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 SACSQ9NZJ4 4579 aa10.77□□□□□ -0.68
ACTB-201ENST00000331789 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.77□□□□□ -0.69
ACTB-201ENST00000331789 IGKV4-1P06312 121 aa10.75□□□□□ -0.69
ACTB-201ENST00000331789 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.73□□□□□ -0.69
ACTB-201ENST00000331789 MOBPQ13875 183 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 DSCR10P59022 87 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 COX7CP15954 63 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GVY2 172 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 SERP2Q8N6R1 65 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-201ENST00000331789 UQCRQO14949 82 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-201ENST00000331789 K7EQZ3 153 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-201ENST00000331789 LRP1BQ9NZR2 4599 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTB-201ENST00000331789 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTB-201ENST00000331789 RYR2Q92736 4967 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTB-201ENST00000331789 PKHD1P08F94 4074 aa10.57□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.56□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 A0A087X002 238 aa10.54□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.54□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 Q96NJ1 140 aa10.54□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.52□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.52□□□□□ -0.72
ACTB-201ENST00000331789 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
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ACTB-201ENST00000331789 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.51□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 A8MWP4 228 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 HCG22E2RYF7 251 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 PRR15Q8IV56 129 aa10.5□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.49□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 J3KT08 172 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 OCR1Q9BZK8 76 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.48□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 C20orf197Q8N268 126 aa10.46□□□□□ -0.73
ACTB-201ENST00000331789 CD164Q04900 197 aa10.46□□□□□ -0.74
ACTB-201ENST00000331789 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.43□□□□□ -0.74
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
ACTB-201ENST00000331789 NDUFB1O75438 58 aa10.41□□□□□ -0.74
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ACTB-201ENST00000331789 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.38□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 APOBP04114 4563 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.35□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GVX0 72 aa10.35□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 CDK2AP2O75956 126 aa10.35□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 KLKP1Q107X0 134 aa10.35□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.35□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.35□□□□□ -0.75
ACTB-201ENST00000331789 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.33□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.33□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 hDV103S1A0JD37 113 aa10.32□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.32□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 A0A0U1RQV1 116 aa10.31□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.31□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 Q5XG85 94 aa10.29□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 RYR3Q15413 4870 aa10.28□□□□□ -0.76
ACTB-201ENST00000331789 H7BZZ5 65 aa10.27□□□□□ -0.76
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