RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 B9D2Q9BPU9 175 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS3-202ENST00000328514 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 IGFL1Q6UW32 110 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 UBE2BP63146 152 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 REG3GQ6UW15 175 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 RYR3Q15413 4870 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 Q5VV11 94 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 A8MUN3 132 aa7.12□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 LIMD2Q9BT23 127 aa7.12□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 PRR4Q16378 134 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 LINC00208Q96KT6 92 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WSZ3 146 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 RETNQ9HD89 108 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-202ENST00000328514 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 H0Y9P7 68 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 UBE2AP49459 152 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 CASC2Q6XLA1 102 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 A8MWP4 228 aa7.06□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.06□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 A0A0G2JQZ4 141 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 A0A1W2PNN7 141 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 CASC10Q5T4H9 136 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 SPRR1BP22528 89 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 CD164Q04900 197 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 Q75L30 129 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.04□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 TENM3Q9P273 2699 aa7.03□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
GINS3-202ENST00000328514 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.02□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 C16orf90A8MZG2 172 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 H0Y9J4 135 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 A8MU10 97 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP10-11P60412 298 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 PRLHP81277 87 aa7□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 PRR15LQ9BU68 103 aa6.99□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 COA5Q86WW8 74 aa6.99□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.97□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 A0A096LNI7 61 aa6.97□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 LCA10Q71F78 164 aa6.97□□□□□ -1.29
GINS3-202ENST00000328514 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.96□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZR54 194 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 A6NN06 94 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 NDUFS5O43920 106 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 A6NED7 52 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 MOBPQ13875 183 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GINS3-202ENST00000328514 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 Q96NJ1 140 aa6.89□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.88□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.87□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.86□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.86□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 TENM2Q9NT68 2774 aa6.85□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 C14orf177Q52M58 125 aa6.85□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.84□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 PCOTHQ58A44 107 aa6.84□□□□□ -1.31
GINS3-202ENST00000328514 HRES1P13985 223 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.83□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.82□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GVX0 72 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 CHTF8P0CG12 524 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 LINC00483Q53H64 154 aa6.81□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 LYSTQ99698 3801 aa6.8□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 SPINK7P58062 85 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS3-202ENST00000328514 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.73□□□□□ -1.33
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