RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.95□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 CRYGAP11844 174 aa6.95□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 HAMPP81172 84 aa6.95□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.95□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.95□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 LY6G6CO95867 125 aa6.93□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 IGFL1Q6UW32 110 aa6.93□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 COX7CP15954 63 aa6.93□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 NREPQ16612 68 aa6.93□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 UQCRQO14949 82 aa6.92□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.91□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 C3orf84H3BNL1 204 aa6.91□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.9□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 UBE2AP49459 152 aa6.9□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 SERP2Q8N6R1 65 aa6.9□□□□□ -1.3
PGA3-201ENST00000325558 PKD1P98161 4303 aa6.9□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 DPH3Q96FX2 82 aa6.9□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 TGP01266 2768 aa6.89□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 A0A0G2JQZ4 141 aa6.89□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 IGKV4-1P06312 121 aa6.89□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 LINC00483Q53H64 154 aa6.89□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 F8WEM9 126 aa6.88□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 SCXQ7RTU7 201 aa6.88□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.88□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 BPY2O14599 106 aa6.87□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP10-2P60368 255 aa6.87□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 DSCR10P59022 87 aa6.86□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 Q6ZSA8 131 aa6.85□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 ZNF861PO60384 105 aa6.84□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.84□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 Q8N9L7 120 aa6.84□□□□□ -1.31
PGA3-201ENST00000325558 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.83□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.82□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.81□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.81□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.81□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 A0A087WSZ3 146 aa6.8□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 IGLV7-43P04211 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.8□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.8□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP10-1P60331 282 aa6.79□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 OCR1Q9BZK8 76 aa6.79□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.79□□□□□ -1.32
PGA3-201ENST00000325558 K7EQZ3 153 aa6.77□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.76□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 KLKP1Q107X0 134 aa6.73□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 Q96NJ1 140 aa6.73□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 LCE6AA0A183 80 aa6.73□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.73□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.72□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 MOBPQ13875 183 aa6.72□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.72□□□□□ -1.33
PGA3-201ENST00000325558 C20orf197Q8N268 126 aa6.71□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 PRR15Q8IV56 129 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 A8MWP4 228 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 HCG22E2RYF7 251 aa6.7□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 H7BZZ5 65 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 J3KT08 172 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 TMEM258P61165 79 aa6.68□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 A0A0U1RQV1 116 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GVY2 172 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 CD164Q04900 197 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 RYR2Q92736 4967 aa6.66□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.65□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.65□□□□□ -1.34
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.64□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.64□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.63□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 SNURFQ9Y675 71 aa6.63□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.62□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 RYR3Q15413 4870 aa6.62□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 A0A087X002 238 aa6.62□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 NDUFC1O43677 76 aa6.62□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.62□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 PKHD1P08F94 4074 aa6.61□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 C5orf47Q569G3 176 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 Q5XG85 94 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 CASC2Q6XLA1 102 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GVX0 72 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 NDUFB1O75438 58 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 FAM236CP0DP71 79 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 hDV103S1A0JD37 113 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 OXTP01178 125 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms