RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 SPINK1P00995 79 aa10.45□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 CD164Q04900 197 aa10.45□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1B0GVX0 72 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 OCR1Q9BZK8 76 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 ITPR1Q14643 2758 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 Q8NDZ9 215 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.42□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.41□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 Q96NJ1 140 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 TNP2Q05952 138 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.4□□□□□ -0.74
ITGA3-202ENST00000320031 COA5Q86WW8 74 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 LRBAP50851 2863 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 SPRR1AP35321 89 aa10.39□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 KALRNO60229 2985 aa10.38□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 FREM2Q5SZK8 3169 aa10.38□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.37□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 EYSQ5T1H1 3165 aa10.37□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.36□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 DMXL1Q9Y485 3027 aa10.36□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 Q1T7F1 81 aa10.35□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.34□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 DSCR10P59022 87 aa10.34□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 ITPR2Q14571 2701 aa10.34□□□□□ -0.75
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1B0GU69 56 aa10.33□□□□□ -0.76
ITGA3-202ENST00000320031 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.32□□□□□ -0.76
ITGA3-202ENST00000320031 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.31□□□□□ -0.76
ITGA3-202ENST00000320031 TACC2O95359 2948 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGA3-202ENST00000320031 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.29□□□□□ -0.76
ITGA3-202ENST00000320031 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.27□□□□□ -0.77
ITGA3-202ENST00000320031 APCP25054 2843 aa10.26□□□□□ -0.77
ITGA3-202ENST00000320031 SPEGQ15772 3267 aa10.25□□□□□ -0.77
ITGA3-202ENST00000320031 ZZEF1O43149 2961 aa10.24□□□□□ -0.77
ITGA3-202ENST00000320031 SPRR1BP22528 89 aa10.22□□□□□ -0.77
ITGA3-202ENST00000320031 HIVEP1P15822 2718 aa10.21□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.2□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.18□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 USP34Q70CQ2 3546 aa10.17□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 LCA10Q71F78 164 aa10.16□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ITGA3-202ENST00000320031 C9orf92A6NGG3 77 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-202ENST00000320031 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.13□□□□□ -0.79
ITGA3-202ENST00000320031 ZANQ9Y493 2812 aa10.12□□□□□ -0.79
ITGA3-202ENST00000320031 J3QL48 77 aa10.11□□□□□ -0.79
ITGA3-202ENST00000320031 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 UQCR11O14957 56 aa10.08□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 Q75L30 129 aa10.05□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 Q6ZR54 194 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 Q5VV11 94 aa10.04□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.03□□□□□ -0.8
ITGA3-202ENST00000320031 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.02□□□□□ -0.81
ITGA3-202ENST00000320031 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.01□□□□□ -0.81
ITGA3-202ENST00000320031 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10□□□□□ -0.81
ITGA3-202ENST00000320031 LCE6AA0A183 80 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP10-2P60368 255 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-202ENST00000320031 LINC00483Q53H64 154 aa9.96□□□□□ -0.81
ITGA3-202ENST00000320031 PANO1I0J062 215 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP10-1P60331 282 aa9.95□□□□□ -0.82
ITGA3-202ENST00000320031 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA3-202ENST00000320031 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
ITGA3-202ENST00000320031 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.9□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.89□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.88□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 Q8N1X5 172 aa9.87□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 HRES1P13985 223 aa9.84□□□□□ -0.83
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.82□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.82□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 NF1P21359 2839 aa9.82□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.81□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.8□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 SPINK7P58062 85 aa9.79□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 LINC01554Q52M75 96 aa9.79□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 PRAC1Q96KF2 57 aa9.78□□□□□ -0.84
ITGA3-202ENST00000320031 FBN2P35556 2912 aa9.77□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.77□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.77□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 Q5W150 140 aa9.75□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 TENM4Q6N022 2769 aa9.73□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.71□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.71□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 Q5VSD8 79 aa9.71□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 Q6ZSA8 131 aa9.71□□□□□ -0.85
ITGA3-202ENST00000320031 A0A087X002 238 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms