RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.63□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV7-43P04211 117 aa8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 FRYQ5TBA9 3013 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.6□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 LAMA1P25391 3075 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL6A5A8TX70 2615 aa8.59□□□□□ -1.03
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A0D9SG42 100 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.58□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF292O60281 2723 aa8.57□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 VCANP13611 3396 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TRAPPC10-201ENST00000291574 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.52□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 OXTP01178 125 aa8.51□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 HRES1P13985 223 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01554Q52M75 96 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q75L30 129 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRAC1Q96KF2 57 aa8.46□□□□□ -1.05
TRAPPC10-201ENST00000291574 SZT2Q5T011 3432 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q5VV11 94 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 FRYLO94915 3013 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPRR1AP35321 89 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 KALRNO60229 2985 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1B0GU33 70 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNP2Q05952 138 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPINK7P58062 85 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPEGQ15772 3267 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 J3QL48 77 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAPPC10-201ENST00000291574 TACC2O95359 2948 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q5W150 140 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 CSAG1Q6PB30 78 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPRR1BP22528 89 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITPR1Q14643 2758 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 H3BS24 57 aa8.26□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 LUZP6Q538Z0 58 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 FLNCQ14315 2725 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATMQ13315 3056 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC10-201ENST00000291574 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZSA8 131 aa8.17□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZZEF1O43149 2961 aa8.17□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.16□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 REV3LO60673 3130 aa8.15□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 DMAC1Q96GE9 116 aa8.15□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL12A1Q99715 3063 aa8.15□□□□□ -1.11
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL6A3P12111 3177 aa8.11□□□□□ -1.11
TRAPPC10-201ENST00000291574 PANO1I0J062 215 aa8.09□□□□□ -1.11
TRAPPC10-201ENST00000291574 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 APCP25054 2843 aa8.08□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 LRBAP50851 2863 aa8.07□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZR54 194 aa8.07□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 HIVEP1P15822 2718 aa8.07□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 S4R3F8 94 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A087X002 238 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 EYSQ5T1H1 3165 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 ITPR2Q14571 2701 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 LINC00483Q53H64 154 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZANQ9Y493 2812 aa8□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 R4GN34 69 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-2P60368 255 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 ROMO1P60602 79 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-1P60331 282 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 A8MU10 97 aa7.96□□□□□ -1.13
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
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