RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 IGFL1Q6UW32 110 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 SPRR4Q96PI1 79 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GW54 56 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 Q8NAQ8 132 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 TNP2Q05952 138 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 REG3GQ6UW15 175 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 STAB1Q9NY15 2570 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 Q75L30 129 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 PRAC1Q96KF2 57 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 MAST4O15021 2626 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 NOTCH1P46531 2555 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 INAFM1C9JVW0 142 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 MOBPQ13875 183 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP10-3P60369 221 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 A6NN06 94 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 SPINK7P58062 85 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 CASC10Q5T4H9 136 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRR-201ENST00000283228 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 H3BPC8 53 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 A8MWP4 228 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 C8orf87E5RJ46 101 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 CDK2AP2O75956 126 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 SPRR1AP35321 89 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 MDFIQ99750 246 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00313P59037 77 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRR-201ENST00000283228 COL6A5A8TX70 2615 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 H3BS24 57 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 TENM3Q9P273 2699 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 HRES1P13985 223 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRR-201ENST00000283228 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 CHTF8P0CG12 524 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 LINC01554Q52M75 96 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 H3BNG1 76 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRR-201ENST00000283228 K7EIL1 84 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRR-201ENST00000283228 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GU69 56 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7□□□□□ -1.29
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRR-201ENST00000283228 ANK2Q01484 3957 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 ACYP2P14621 99 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GVX0 72 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 A0A087X002 238 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP10-11P60412 298 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 CSAG1Q6PB30 78 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 COL7A1Q02388 2944 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-201ENST00000283228 Q6ZR54 194 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRR-201ENST00000283228 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-201ENST00000283228 TENM2Q9NT68 2774 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-201ENST00000283228 SPINK1P00995 79 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRR-201ENST00000283228 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRR-201ENST00000283228 Q5W150 140 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRR-201ENST00000283228 UQCR11O14957 56 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms