RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.87□□□□□ -1.31
URB2-201ENST00000258243 CDH23Q9H251 3354 aa6.87□□□□□ -1.31
URB2-201ENST00000258243 ITPR3Q14573 2671 aa6.87□□□□□ -1.31
URB2-201ENST00000258243 LCE6AA0A183 80 aa6.86□□□□□ -1.31
URB2-201ENST00000258243 Q5VV11 94 aa6.86□□□□□ -1.31
URB2-201ENST00000258243 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
URB2-201ENST00000258243 PLAC4Q8WY50 150 aa6.84□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.82□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 HRES1P13985 223 aa6.82□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.81□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.8□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 Q6ZSA8 131 aa6.8□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 OXTP01178 125 aa6.79□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.78□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.78□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 CFAP54Q96N23 3096 aa6.78□□□□□ -1.32
URB2-201ENST00000258243 USP24Q9UPU5 2620 aa6.76□□□□□ -1.33
URB2-201ENST00000258243 Q8NDZ9 215 aa6.75□□□□□ -1.33
URB2-201ENST00000258243 Q5VSD8 79 aa6.75□□□□□ -1.33
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URB2-201ENST00000258243 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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URB2-201ENST00000258243 SZT2Q5T011 3432 aa6.73□□□□□ -1.33
URB2-201ENST00000258243 ATRQ13535 2644 aa6.72□□□□□ -1.33
URB2-201ENST00000258243 M0R2T5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 NDUFAF8A1L188 74 aa6.69□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.69□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 KRTAP10-1P60331 282 aa6.67□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.67□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 ZNF292O60281 2723 aa6.66□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 KRTAP10-2P60368 255 aa6.65□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.65□□□□□ -1.34
URB2-201ENST00000258243 S4R3F8 94 aa6.63□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.63□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 VCANP13611 3396 aa6.63□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 TRANK1O15050 2925 aa6.62□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 R4GN34 69 aa6.61□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 TRIOO75962 3097 aa6.6□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.6□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.6□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 SPRR1AP35321 89 aa6.59□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 Q6ZR54 194 aa6.59□□□□□ -1.35
URB2-201ENST00000258243 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.57□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 COL6A3P12111 3177 aa6.56□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 A6NN06 94 aa6.56□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 SPRR1BP22528 89 aa6.54□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 MGAQ8IWI9 3026 aa6.54□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 EYSQ5T1H1 3165 aa6.54□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.53□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
URB2-201ENST00000258243 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.53□□□□□ -1.36
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URB2-201ENST00000258243 AKAP13Q12802 2813 aa6.52□□□□□ -1.37
URB2-201ENST00000258243 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.52□□□□□ -1.37
URB2-201ENST00000258243 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.52□□□□□ -1.37
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URB2-201ENST00000258243 CHD6Q8TD26 2715 aa6.49□□□□□ -1.37
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URB2-201ENST00000258243 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.46□□□□□ -1.37
URB2-201ENST00000258243 A0A087X002 238 aa6.46□□□□□ -1.38
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URB2-201ENST00000258243 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.45□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 M0QZ58 72 aa6.45□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 COL6A5A8TX70 2615 aa6.45□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.45□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.44□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 PANO1I0J062 215 aa6.44□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 FRYQ5TBA9 3013 aa6.43□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 STAB1Q9NY15 2570 aa6.41□□□□□ -1.38
URB2-201ENST00000258243 LAMA1P25391 3075 aa6.4□□□□□ -1.38
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URB2-201ENST00000258243 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.38□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 PP632Q6XCG6 107 aa6.37□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 SPEGQ15772 3267 aa6.35□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.34□□□□□ -1.39
URB2-201ENST00000258243 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.32□□□□□ -1.4
URB2-201ENST00000258243 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.31□□□□□ -1.4
URB2-201ENST00000258243 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.31□□□□□ -1.4
URB2-201ENST00000258243 KALRNO60229 2985 aa6.31□□□□□ -1.4
URB2-201ENST00000258243 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
URB2-201ENST00000258243 REV3LO60673 3130 aa6.28□□□□□ -1.4
URB2-201ENST00000258243 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.27□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 ITPR2Q14571 2701 aa6.26□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 A8MU10 97 aa6.26□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 A8MUU9 505 aa6.26□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 NOTCH1P46531 2555 aa6.25□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 USP34Q70CQ2 3546 aa6.25□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 FRYLO94915 3013 aa6.25□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.22□□□□□ -1.41
URB2-201ENST00000258243 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.22□□□□□ -1.41
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