RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 ATRQ13535 2644 aa13.53□□□□□ -0.24
ODC1-201ENST00000234111 IGFL1Q6UW32 110 aa13.51□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 A0A087WSZ3 146 aa13.5□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 A6NED7 52 aa13.5□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa13.48□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa13.48□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 INAFM1C9JVW0 142 aa13.48□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 Q75L30 129 aa13.48□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.47□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.47□□□□□ -0.25
ODC1-201ENST00000234111 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13.45□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 BAHCC1Q9P281 2608 aa13.45□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 CASC2Q6XLA1 102 aa13.45□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 A6NN06 94 aa13.44□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.44□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 COA5Q86WW8 74 aa13.43□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.42□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 H3BPC8 53 aa13.42□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.42□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa13.41□□□□□ -0.26
ODC1-201ENST00000234111 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ODC1-201ENST00000234111 NDUFS5O43920 106 aa13.39□□□□□ -0.27
ODC1-201ENST00000234111 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ODC1-201ENST00000234111 REG3GQ6UW15 175 aa13.36□□□□□ -0.27
ODC1-201ENST00000234111 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.36□□□□□ -0.27
ODC1-201ENST00000234111 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa13.36□□□□□ -0.27
ODC1-201ENST00000234111 H3BNG1 76 aa13.33□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 PRLHP81277 87 aa13.32□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 CASC10Q5T4H9 136 aa13.32□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa13.3□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 STAB1Q9NY15 2570 aa13.29□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 SPAG11AQ6PDA7 123 aa13.29□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 PCOTHQ58A44 107 aa13.29□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.28□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 A8MWP4 228 aa13.28□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 MOBPQ13875 183 aa13.28□□□□□ -0.28
ODC1-201ENST00000234111 C7orf65Q6ZTY9 151 aa13.27□□□□□ -0.29
ODC1-201ENST00000234111 MAST4O15021 2626 aa13.27□□□□□ -0.29
ODC1-201ENST00000234111 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
ODC1-201ENST00000234111 LINC00472Q9H8W2 130 aa13.23□□□□□ -0.29
ODC1-201ENST00000234111 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa13.23□□□□□ -0.29
ODC1-201ENST00000234111 H0Y9J4 135 aa13.21□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 SPINK7P58062 85 aa13.2□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 PLAC8Q9NZF1 115 aa13.2□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa13.19□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 COL6A5A8TX70 2615 aa13.18□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.17□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.16□□□□□ -0.3
ODC1-201ENST00000234111 CSMD3Q7Z407 3707 aa13.14□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.13□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 TENM3Q9P273 2699 aa13.13□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 A0A096LNI7 61 aa13.11□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 C11orf45Q8TAV5 145 aa13.11□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.11□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 ANK2Q01484 3957 aa13.09□□□□□ -0.31
ODC1-201ENST00000234111 HRES1P13985 223 aa13.08□□□□□ -0.32
ODC1-201ENST00000234111 NOTCH1P46531 2555 aa13.06□□□□□ -0.32
ODC1-201ENST00000234111 TENM2Q9NT68 2774 aa13.06□□□□□ -0.32
ODC1-201ENST00000234111 C8orf87E5RJ46 101 aa13.02□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa13.02□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa13.01□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 Q6ZR54 194 aa13□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 LINC00313P59037 77 aa13□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 PRAC1Q96KF2 57 aa13□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 SPRR1BP22528 89 aa12.99□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 DNAH10Q8IVF4 4471 aa12.99□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa12.98□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.97□□□□□ -0.33
ODC1-201ENST00000234111 Q96NJ1 140 aa12.95□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.94□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.94□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 C8orf17Q9NRJ1 99 aa12.94□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.93□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP10-11P60412 298 aa12.91□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.91□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 C4orf48Q5BLP8 95 aa12.9□□□□□ -0.34
ODC1-201ENST00000234111 CHTF8P0CG12 524 aa12.89□□□□□ -0.35
ODC1-201ENST00000234111 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa12.88□□□□□ -0.35
ODC1-201ENST00000234111 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.88□□□□□ -0.35
ODC1-201ENST00000234111 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.88□□□□□ -0.35
ODC1-201ENST00000234111 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.83□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 K7EIL1 84 aa12.83□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 LYSTQ99698 3801 aa12.81□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 A0A1B0GVX0 72 aa12.8□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 COL7A1Q02388 2944 aa12.8□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 A0A087X002 238 aa12.78□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa12.78□□□□□ -0.36
ODC1-201ENST00000234111 MDFIQ99750 246 aa12.77□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 ALMS1Q8TCU4 4167 aa12.75□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 LINC01554Q52M75 96 aa12.74□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.73□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.72□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 CDK2AP2O75956 126 aa12.72□□□□□ -0.37
ODC1-201ENST00000234111 Q5W150 140 aa12.7□□□□□ -0.38
ODC1-201ENST00000234111 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12.68□□□□□ -0.38
ODC1-201ENST00000234111 ACYP2P14621 99 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms