RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100497.10

Actb-201, Transcript of Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Actb, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Dendrite, Endoplasmic reticulum, Exosome, Growth cone, Lamellipodium, Perinuclear, Ribosome, Somatodendritic compartment .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actb-201ENSMUST00000100497 Sh3bgrl2Q8BG73 107 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Scnm1Q8K136 229 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1402Q8VET1 320 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Rasl11bQ922H7 247 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Borcs7Q9CRC6 105 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Hyls1Q9CXX0 307 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Spink12Q9D256 87 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tomm40Q9QYA2 361 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Akap9Q70FJ1 3797 aa9.56□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Ly6lH3BJG9 140 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 CrygbP04344 175 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Sox15P43267 231 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Defb18Q30KP5 85 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10118Q8C8J5 116 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Q9CX63 252 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 ApomQ9Z1R3 190 aa9.55□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Igkv1-133A0A0B4J1H8 120 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp825A0A1Y7VK00 292 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm15557A6PWY0 234 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr235E9Q9Z6 312 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10130F6ZHM5 101 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 5730522E02RikQ5SP45 163 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zmat5Q9CQR5 170 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 SNORCQ9CXL7 121 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv1-53A0A075B5W3 117 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gosr1O88630 250 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Fabp4P04117 132 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 LalbaP29752 143 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1336Q8VGH5 314 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 EpcamQ99JW5 315 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Nus1Q99LJ8 297 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Mrpl16Q99N93 251 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Fxyd4Q9D2W0 88 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam241bQ9D882 120 aa9.54□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp114B2RRA8 586 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp867E9Q2M4 473 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Col8a1Q00780 744 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem241Q3UME2 297 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf48Q3US17 591 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf664Q4VA44 261 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem11Q8BK08 190 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Bub3Q9WVA3 326 aa9.53□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm17727E9Q4V7 109 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gpm6bP35803 328 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Rplp1P47955 114 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Acrv1P50289 261 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Prrx2Q06348 247 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Spint3Q3UW09 88 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm5868Q8BJG1 145 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem177Q8BPE4 311 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 QrfpQ8CE23 124 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam24aQ8CF27 98 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Nrn1Q8CFV4 142 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 TdhQ8K3F7 373 aa9.52□□□□□ -0.88
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam208bQ5DTT3 2382 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Med12A2AGH6 2190 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 1810011H11RikE9PVZ2 95 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 CtsgP28293 261 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 TbpP29037 316 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 CebpgP53568 150 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Nbl1Q61477 178 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Usmg5Q78IK2 58 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Tnfsf18Q7TS55 173 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn1r202Q8R259 302 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr365Q8VFT2 312 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Leprotl1Q9CQ74 131 aa9.52□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav14-3A0A075B607 120 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav16nA0A075B634 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav14d-1A0A075B6B1 121 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Igsf23B2RTN2 239 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm6176J3QK59 301 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Socs3O35718 225 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Ins2P01326 110 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm4567Q3UTA8 301 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 A130051J06RikQ8CAU1 227 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Ifitm2Q99J93 144 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfyve26Q5DU37 2529 aa9.51□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv9-1A0A0B4J1P3 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 1500009C09RikD3YYW9 81 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Tstd1E9PY03 133 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm20517G3UVU6 152 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Psmg4P0C7N9 123 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Lynx1P0DP60 116 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10775Q3V290 127 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm11733Q8BQP1 125 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Prr9Q8BV84 116 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Ttc28Q80XJ3 2450 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gp9O88186 177 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Saa3P04918 122 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Cela2aP05208 271 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm5941Q497P9 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Trav2Q5R1I9 109 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Samd10Q7TST3 202 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1262Q8VGN2 304 aa9.5□□□□□ -0.89
Actb-201ENSMUST00000100497 Q9D7E4 109 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50 ms