RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637434.1

SPTAN1-235, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 1,496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 SPANXCQ9NY87 97 aa7.33□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.32□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV6-57P01721 117 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 SPATA45Q537H7 98 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 C14orf144Q96I85 54 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 VAMP8Q9BV40 100 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 TNXBP22105 4242 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 COX8AP10176 69 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 SPRR1AP35321 89 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP10-8P60410 259 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 IFITM1P13164 125 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A087X002 238 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 B5MCH6 92 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 TSTD3H0UI37 97 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 A6NDN8 102 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 Q6ZVH6 145 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 ERC2-IT1O76042 136 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 COPS9Q8WXC6 57 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 HIST1H4GQ99525 98 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 PRO1933Q9H354 126 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 Q9BRP9 147 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 A4D1N5 150 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 Q6ZRX8 168 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 C6orf99Q4VX62 202 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 SPRR4Q96PI1 79 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 DLEU1O43261 78 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 CRYGAP11844 174 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-235ENST00000637434 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 COX7BP24311 80 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 TSPAN13O95857 204 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 HIGD1BQ9P298 99 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 H7C2G1 150 aa7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.14□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 CFC1BP0CG36 223 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 CFC1P0CG37 223 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 FXYD2P54710 66 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC00483Q53H64 154 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 CEND1Q8N111 149 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.13□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A1B0GWB2 263 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 RAB37Q96AX2 223 aa7.12□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 M0R143 59 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 MOBPQ13875 183 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.11□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 TAL2Q16559 108 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 Q8NBF4 154 aa7.1□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A1B0GV90 55 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 K7ERJ3 54 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 HSD52Q0P140 79 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 Q1RN00 199 aa7.09□□□□□ -1.27
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A0B4J2C4 111 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.07□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 LRP2P98164 4655 aa7.07□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 VAMP3Q15836 100 aa7.07□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 A6NJY4 79 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 PRR4Q16378 134 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC00575Q6W349 94 aa7.06□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 SLC25A20O43772 301 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 hADV29S1A0JD25 119 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 SPRR1BP22528 89 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms