RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637340.1

EFHC1-232, Transcript of EF-hand domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EFHC1, Length 4,004 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1-232ENST00000637340 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.45□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 H3BQ85 93 aa7.44□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 LINC00167Q96N53 147 aa7.44□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 BSNQ9UPA5 3926 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 IGLV6-57P01721 117 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 LELP1Q5T871 98 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 LYRM9A8MSI8 78 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 A8MUN3 132 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 SYCNQ0VAF6 134 aa7.43□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 SMR3AQ99954 134 aa7.42□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 IGKV4-1P06312 121 aa7.42□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.42□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.42□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 NDUFS5O43920 106 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 COL6A5A8TX70 2615 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 PRR15LQ9BU68 103 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 X6R8D5 127 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 VPS13CQ709C8 3753 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 A6NED7 52 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.41□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 H0Y9J4 135 aa7.4□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 BCE1O60756 84 aa7.4□□□□□ -1.22
EFHC1-232ENST00000637340 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.38□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 K7EQZ3 153 aa7.37□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 A0A087WSZ3 146 aa7.37□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.37□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.37□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 VPREB1P12018 145 aa7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 PCOTHQ58A44 107 aa7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 C7orf33Q8WU49 177 aa7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 C16orf95Q9H693 158 aa7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 EPM2AB3EWF7 344 aa7.35□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 Q6ZRP5 223 aa7.35□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 OCR1Q9BZK8 76 aa7.34□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 FAM168BA1KXE4 195 aa7.34□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 ITPR2Q14571 2701 aa7.34□□□□□ -1.23
EFHC1-232ENST00000637340 FSHBP01225 129 aa7.34□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 PSCAO43653 123 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 Q6ZTC4 211 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 F8WDY8 70 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 MAST4O15021 2626 aa7.33□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 PRLHP81277 87 aa7.32□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 Q8N377 158 aa7.32□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 HCG22E2RYF7 251 aa7.32□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 UBE2AP49459 152 aa7.31□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.3□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 H0Y9P7 68 aa7.3□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 B9D2Q9BPU9 175 aa7.3□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 A0A1W2PNM2 257 aa7.3□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 hDV103S1A0JD37 113 aa7.29□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.29□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.29□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 PDZD2O15018 2839 aa7.28□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 Q8NBF4 154 aa7.28□□□□□ -1.24
EFHC1-232ENST00000637340 NDUFB1O75438 58 aa7.27□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 CASC2Q6XLA1 102 aa7.27□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 A8MU10 97 aa7.26□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 ERC2-IT1O76042 136 aa7.26□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.25□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 CDK2AP2O75956 126 aa7.25□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.25□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 INAFM1C9JVW0 142 aa7.24□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 Q6ZRX8 168 aa7.24□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 VWFP04275 2813 aa7.23□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 STAB1Q9NY15 2570 aa7.23□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 C15orf56Q8N910 161 aa7.23□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 Q8NAQ8 132 aa7.23□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.23□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 PRR34Q9NV39 138 aa7.22□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.21□□□□□ -1.25
EFHC1-232ENST00000637340 DSCR10P59022 87 aa7.21□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.2□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 REG3GQ6UW15 175 aa7.2□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 Q9BRP9 147 aa7.2□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.19□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 KRTAP10-3P60369 221 aa7.19□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 CASC10Q5T4H9 136 aa7.18□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.18□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.17□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 PRR15Q8IV56 129 aa7.17□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 IGFL1Q6UW32 110 aa7.16□□□□□ -1.26
EFHC1-232ENST00000637340 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.14□□□□□ -1.27
EFHC1-232ENST00000637340 LIMD2Q9BT23 127 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms