RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.46□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF861PO60384 105 aa6.46□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 KRTAP10-11P60412 298 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A096LNT2 108 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 MUC4Q99102 2169 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N377 158 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A087WTM6 91 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1B0GVX0 72 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZSA8 131 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 CEP350Q5VT06 3117 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 IGFL1Q6UW32 110 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV7-43P04211 117 aa6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PNM2 257 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-228ENST00000635853 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.4□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 PRAC1Q96KF2 57 aa6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00483Q53H64 154 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 C15orf56Q8N910 161 aa6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 LUZP6Q538Z0 58 aa6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N1X5 172 aa6.36□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.36□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 A6NN06 94 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.34□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 SPRR4Q96PI1 79 aa6.34□□□□□ -1.39
SPTAN1-228ENST00000635853 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.33□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 IGF2RP11717 2491 aa6.33□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A0G2JQZ4 141 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PNN7 141 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 SPINK7P58062 85 aa6.31□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 PRR34Q9NV39 138 aa6.3□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.28□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SPTAN1-228ENST00000635853 KRTAP10-3P60369 221 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 CSAG1Q6PB30 78 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.27□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 JMJD1CQ15652 2540 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 HRES1P13985 223 aa6.26□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.25□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.25□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8NDZ9 215 aa6.24□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 LCE6AA0A183 80 aa6.23□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 CASC10Q5T4H9 136 aa6.22□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
SPTAN1-228ENST00000635853 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-228ENST00000635853 TNP2Q05952 138 aa6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-228ENST00000635853 LRRK2Q5S007 2527 aa6.21□□□□□ -1.42
SPTAN1-228ENST00000635853 S4R3F8 94 aa6.2□□□□□ -1.42
SPTAN1-228ENST00000635853 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.18□□□□□ -1.42
SPTAN1-228ENST00000635853 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.15□□□□□ -1.42
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1B0GU33 70 aa6.14□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 A8MU10 97 aa6.14□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A087X002 238 aa6.12□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.11□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 DMAC1Q96GE9 116 aa6.1□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.09□□□□□ -1.43
SPTAN1-228ENST00000635853 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 R4GN34 69 aa6.08□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.08□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 SPRR1AP35321 89 aa6.07□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 Q5VSD8 79 aa6.07□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 PLAC4Q8WY50 150 aa6.06□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.06□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 BRCA2P51587 3418 aa6.05□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 CENPFP49454 3210 aa6.05□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZR54 194 aa6.04□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.04□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A0A0MQY5 61 aa6.03□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.03□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.02□□□□□ -1.44
SPTAN1-228ENST00000635853 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.99□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.99□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.99□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.98□□□□□ -1.45
SPTAN1-228ENST00000635853 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa5.98□□□□□ -1.45
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