RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf52A6NGY3 159 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LEPROTO15243 131 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFC2O95298 119 aa14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 IFITM2Q01629 132 aa14.67□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NPC2P61916 151 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa14.66□□□□□ -0.06
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QQQ9 107 aa14.63□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR1BP22528 89 aa14.62□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.61□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C2G1 150 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HSBP1O75506 76 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 NMUP48645 174 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 HERVK_113P61574 105 aa14.59□□□□□ -0.07
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.58□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL37P61927 97 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.57□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.56□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PLNP26678 52 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 Q1RN00 199 aa14.55□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 CD164Q04900 197 aa14.54□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO1933Q9H354 126 aa14.53□□□□□ -0.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TAL2Q16559 108 aa14.52□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.51□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.5□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DPM2O94777 84 aa14.49□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf195Q5TG92 126 aa14.49□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PMCHL2Q9BQD1 86 aa14.49□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 LEPROTL1O95214 131 aa14.48□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0J9YXY3 114 aa14.47□□□□□ -0.09
CAPNS1-217ENST00000629983 COX7BP24311 80 aa14.45□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6Q795 121 aa14.45□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKCP01834 107 aa14.44□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 APOC3P02656 99 aa14.44□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1D1P51857 326 aa14.43□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 Q5XG85 94 aa14.43□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXCQ9NY87 97 aa14.43□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.41□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CAPNS1-217ENST00000629983 SNAPINO95295 136 aa14.39□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf99Q4VX62 202 aa14.39□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.39□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.39□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JQZ4 141 aa14.38□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 FABP4P15090 132 aa14.38□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM29Q86T20 159 aa14.38□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.38□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA5Q16718 116 aa14.36□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SERF1AO75920 110 aa14.35□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SVBPQ8N300 66 aa14.35□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 USH2AO75445 5202 aa14.34□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 SSPOA2VEC9 5147 aa14.33□□□□□ -0.11
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PLD3 99 aa14.32□□□□□ -0.12
CAPNS1-217ENST00000629983 YPEL4Q96NS1 127 aa14.32□□□□□ -0.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TCL1BO95988 128 aa14.3□□□□□ -0.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LITAFQ99732 161 aa14.3□□□□□ -0.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00310P59036 64 aa14.28□□□□□ -0.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CFC1P0CG37 223 aa14.26□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.26□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM17BO60830 172 aa14.25□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGC2P03986 189 aa14.24□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa14.23□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PCP2Q8IVA1 136 aa14.22□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.21□□□□□ -0.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.2□□□□□ -0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GWB2 263 aa14.2□□□□□ -0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF815PA8K554 130 aa14.18□□□□□ -0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa14.15□□□□□ -0.14
CAPNS1-217ENST00000629983 F8WEM9 126 aa14.14□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NDN8 102 aa14.12□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa14.12□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 Q75L30 129 aa14.11□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.11□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf202A1L168 122 aa14.08□□□□□ -0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 A4D1N5 150 aa14.06□□□□□ -0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.06□□□□□ -0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.03□□□□□ -0.16
CAPNS1-217ENST00000629983 COPS9Q8WXC6 57 aa14.02□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa14□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.99□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 Q96NJ1 140 aa13.99□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01545Q5VT33 79 aa13.97□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6JHZ5 121 aa13.97□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.97□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC2BQ92478 149 aa13.97□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 IFITM1P13164 125 aa13.96□□□□□ -0.17
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM11BQ8TCY0 68 aa13.95□□□□□ -0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 IGFL1Q6UW32 110 aa13.94□□□□□ -0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa13.93□□□□□ -0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 PET117Q6UWS5 81 aa13.92□□□□□ -0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.91□□□□□ -0.18
CAPNS1-217ENST00000629983 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.91□□□□□ -0.18
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