RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629212.2

PCBP1-AS1-341, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 827 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP10-12P60413 245 aa3.17□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.17□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 BPTFQ12830 3046 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LINC00575Q6W349 94 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ITPR1Q14643 2758 aa3.16□□□□□ -1.9
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 S100A3P33764 101 aa3.15□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPINK7P58062 85 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CREBBPQ92793 2442 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PTPN13Q12923 2485 aa3.14□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TENM4Q6N022 2769 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ANKRD36A6QL64 1941 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LAMA1P25391 3075 aa3.13□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 A0A096LNT2 108 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 A0A1B0GVY2 172 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 IFI6P09912 130 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KNTC1P50748 2209 aa3.12□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NOTCH2Q04721 2471 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PIN1P1O15428 100 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NREPQ16612 68 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PLAC4Q8WY50 150 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LAMA5O15230 3695 aa3.11□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KALRNO60229 2985 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NCR3O14931 201 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 Q6ZRX8 168 aa3.1□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP12-2P59991 146 aa3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.09□□□□□ -1.91
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ZFHX3Q15911 3703 aa3.08□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LCE6AA0A183 80 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DEFB112Q30KQ8 113 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 GAFA1Q96PS6 74 aa3.07□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 A0A1B0GU69 56 aa3.06□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MGAQ8IWI9 3026 aa3.06□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 COL12A1Q99715 3063 aa3.06□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KNL1Q8NG31 2342 aa3.05□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LINC01549A6NIU2 74 aa3.05□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ATMQ13315 3056 aa3.05□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 G3V318 75 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DNAJC13O75165 2243 aa3.04□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 HAMPP81172 84 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DEFB133Q30KQ1 61 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 DEFB109BQ30KR1 87 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 LRRK2Q5S007 2527 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 FBN2P35556 2912 aa3.03□□□□□ -1.92
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 NBASA2RRP1 2371 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 F8P00451 2351 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP10-1P60331 282 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 KRTAP10-3P60369 221 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 U3KQA8 63 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.02□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ITPR3Q14573 2671 aa3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 POLQO75417 2590 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 COX6B1P14854 86 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 UBL5Q9BZL1 73 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 MED13LQ71F56 2210 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-341ENST00000629212 ABCA2Q9BZC7 2435 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms