RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 LINC00528Q8N1L1 170 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC168Q8NDH2 2452 aa2.7□□□□□ -1.98
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ANKRD28-215ENST00000624145 Q8NAQ8 132 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 CACNA1AO00555 2505 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 PRO0461Q9UI25 63 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1W2PPR1 153 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 M0R2T5 61 aa2.69□□□□□ -1.98
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ANKRD28-215ENST00000624145 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.68□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
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ANKRD28-215ENST00000624145 IGLV7-43P04211 117 aa2.67□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 TTC28Q96AY4 2481 aa2.67□□□□□ -1.98
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ANKRD28-215ENST00000624145 HRES1P13985 223 aa2.66□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
ANKRD28-215ENST00000624145 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.66□□□□□ -1.98
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ANKRD28-215ENST00000624145 SPRR4Q96PI1 79 aa2.64□□□□□ -1.99
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ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1W2PNN7 141 aa2.63□□□□□ -1.99
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ANKRD28-215ENST00000624145 CFAP54Q96N23 3096 aa2.59□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 Q75L30 129 aa2.59□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
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ANKRD28-215ENST00000624145 PLAC4Q8WY50 150 aa2.57□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.56□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 COL4A2P08572 1712 aa2.55□□□□□ -2
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ANKRD28-215ENST00000624145 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 JMJD1CQ15652 2540 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 KLK9Q2XQG4 91 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 CASC10Q5T4H9 136 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 PRAC1Q96KF2 57 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 OCR1Q9BZK8 76 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 C10orf142B7Z368 130 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 ROMO1P60602 79 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-215ENST00000624145 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.54□□□□□ -2
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