RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603487.1

SMC2-AS1-201, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC2-AS1, Length 7,020 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.37□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q5XG85 94 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CNFNQ9BYD5 112 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1B0GVX0 72 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WISP2O76076 250 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LRRK2Q5S007 2527 aa3.36□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.35□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1B0GUV1 79 aa3.35□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.35□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1W2PNN7 141 aa3.35□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 J3QL48 77 aa3.34□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa3.34□□□□□ -1.87
SMC2-AS1-201ENST00000603487 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.34□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A096LNJ9 63 aa3.34□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HRES1P13985 223 aa3.34□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FHL3Q13643 280 aa3.33□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C5orf42Q9H799 3197 aa3.33□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q5VV11 94 aa3.33□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BRI3O95415 125 aa3.32□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.32□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KLK9Q2XQG4 91 aa3.32□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q6ZSN1 163 aa3.32□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.31□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8NA96 180 aa3.31□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.31□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGFL1Q6UW32 110 aa3.31□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q6ZR54 194 aa3.31□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.29□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.29□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.29□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C15orf56Q8N910 161 aa3.29□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 BRCA2P51587 3418 aa3.29□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.29□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ADAMTS20P59510 1910 aa3.28□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C16orf95Q9H693 158 aa3.28□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TRANK1O15050 2925 aa3.28□□□□□ -1.88
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LMO4P61968 165 aa3.27□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.27□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 IGLV1-40P01703 118 aa3.27□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.27□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LAMA3Q16787 3333 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A1W2PNM2 257 aa3.26□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LINC01546A6NGU7 62 aa3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 R4GN34 69 aa3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 S4R3F8 94 aa3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A0G2JQZ4 141 aa3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 M0R2T5 61 aa3.25□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PTPRBP23467 1997 aa3.24□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 MTORP42345 2549 aa3.24□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FAM168BA1KXE4 195 aa3.24□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 HTTP42858 3142 aa3.23□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 A0A0C4DFX4 3053 aa3.23□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.23□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.23□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.23□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF292O60281 2723 aa3.22□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 TNP2Q05952 138 aa3.22□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.22□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8N377 158 aa3.22□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q6ZSA8 131 aa3.21□□□□□ -1.89
SMC2-AS1-201ENST00000603487 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.21□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.21□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 Q8NDZ9 215 aa3.2□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 JMJD1CQ15652 2540 aa3.2□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 LITAFQ99732 161 aa3.2□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.2□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PRR34Q9NV39 138 aa3.19□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 SMR3AQ99954 134 aa3.19□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PCSK5Q92824 1860 aa3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 M0QZ58 72 aa3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 H3BNG1 76 aa3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 PP632Q6XCG6 107 aa3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 CDH23Q9H251 3354 aa3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 KRTAP10-9P60411 292 aa3.18□□□□□ -1.9
SMC2-AS1-201ENST00000603487 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms