RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 J3QR89 54 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 K7ERJ3 54 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 IFITM1P13164 125 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZRP5 223 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 LITAFQ99732 161 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.95□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.94□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 RAB37Q96AX2 223 aa4.94□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 A0A087WYN8 130 aa4.93□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 SCXQ7RTU7 201 aa4.93□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.93□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.93□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 F8W1H4 67 aa4.92□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 CHTF8P0CG12 524 aa4.92□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.92□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.92□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 A4D1N5 150 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 M0QXV9 152 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2BP63146 152 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.91□□□□□ -1.62
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0U1RRA0 63 aa4.9□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 TSPAN13O95857 204 aa4.9□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 CFC1BP0CG36 223 aa4.9□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 CFC1P0CG37 223 aa4.9□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.9□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.89□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 SCGB1A1P11684 91 aa4.89□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.88□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 PANO1I0J062 215 aa4.88□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFC2O95298 119 aa4.88□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.88□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.88□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.88□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 C22orf24Q9Y442 160 aa4.87□□□□□ -1.63
ZNF548-208ENST00000597576 FAM168BA1KXE4 195 aa4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 VPREB1P12018 145 aa4.86□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 NPC2P61916 151 aa4.84□□□□□ -1.63
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ZNF548-208ENST00000597576 TMEM126AQ9H061 195 aa4.83□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 PRO0461Q9UI25 63 aa4.83□□□□□ -1.64
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ZNF548-208ENST00000597576 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.82□□□□□ -1.64
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ZNF548-208ENST00000597576 LINC01600Q96MT4 127 aa4.81□□□□□ -1.64
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ZNF548-208ENST00000597576 A0A1B0GV72 72 aa4.8□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.8□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 LST1O00453 97 aa4.8□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.8□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 DIRC1Q969H9 104 aa4.8□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.8□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.79□□□□□ -1.64
ZNF548-208ENST00000597576 H3BT86 120 aa4.79□□□□□ -1.64
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