RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592597.1

POLR2E-210, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 440 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-210ENST00000592597 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 KIAA0087Q14695 138 aa9.41□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.4□□□□□ -0.9
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.39□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 F8W1H4 67 aa9.38□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 C2orf82Q6UX34 121 aa9.38□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 SYCNQ0VAF6 134 aa9.37□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.37□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.37□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 ATXN8Q156A1 80 aa9.36□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 PRR4Q16378 134 aa9.36□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 RNF151Q2KHN1 245 aa9.36□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 CARD19Q96LW7 228 aa9.36□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 CAMK2N2Q96S95 79 aa9.35□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 H3BMG7 143 aa9.34□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFC2O95298 119 aa9.34□□□□□ -0.91
POLR2E-210ENST00000592597 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.33□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 A0A096LNI7 61 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 TRIAP1O43715 76 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 TCL1BO95988 128 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 Q6ZRP5 223 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.32□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 C10orf25Q5T742 122 aa9.31□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.3□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.3□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.3□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.28□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 K7ERU9 68 aa9.28□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.28□□□□□ -0.92
POLR2E-210ENST00000592597 H0YGX0 51 aa9.27□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 J3QR89 54 aa9.27□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 TMEM126AQ9H061 195 aa9.27□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 IGKV2D-28P01615 120 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.26□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 M0QXV9 152 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 LST1O00453 97 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 SNCGO76070 127 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.25□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 C9JAW5 83 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 PRO0461Q9UI25 63 aa9.24□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 SLC25A20O43772 301 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 TRACP01848 142 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR2E-210ENST00000592597 H3BT86 120 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE2BQ13066 116 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 CLEC2BQ92478 149 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 MUC17Q685J3 4493 aa9.2□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.2□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 NCR3O14931 201 aa9.19□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 DNAL4O96015 105 aa9.19□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 ETDBQ3ZM63 59 aa9.19□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 TEN1Q86WV5 123 aa9.19□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 C1orf137Q5JT78 98 aa9.18□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 MTURNQ8N3F0 131 aa9.18□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1B0GX51 115 aa9.17□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.17□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.17□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 M0R378 163 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE2EQ4V326 116 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.16□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 A0A1W2PNN7 141 aa9.15□□□□□ -0.94
POLR2E-210ENST00000592597 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV6-57P01721 117 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 VPREB1P12018 145 aa9.12□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.12□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 DIRC1Q969H9 104 aa9.12□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.11□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 FAM168BA1KXE4 195 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 GHRHP01286 108 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 C6orf99Q4VX62 202 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 VPS25Q9BRG1 176 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 H0Y9J4 135 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 H3BQ85 93 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV7-43P04211 117 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR2E-210ENST00000592597 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR2E-210ENST00000592597 Q8NDZ9 215 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR2E-210ENST00000592597 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms