RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588177.1

SOX9-AS1-215, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 465 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-215ENST00000588177 REG3GQ6UW15 175 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-215ENST00000588177 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.05□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-215ENST00000588177 DIRC1Q969H9 104 aa6.05□□□□□ -1.44
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TSPAN13O95857 204 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.04□□□□□ -1.44
SOX9-AS1-215ENST00000588177 VAMP3Q15836 100 aa6.03□□□□□ -1.44
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.02□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-215ENST00000588177 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.01□□□□□ -1.45
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.01□□□□□ -1.45
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 C9orf118A6NHY6 69 aa6□□□□□ -1.45
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.99□□□□□ -1.45
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 FABP2P12104 132 aa5.97□□□□□ -1.45
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A1W2PPM0 123 aa5.96□□□□□ -1.46
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.96□□□□□ -1.46
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 IGLV7-43P04211 117 aa5.95□□□□□ -1.46
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.93□□□□□ -1.46
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q9BRP9 147 aa5.92□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TRACP01848 142 aa5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.9□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-215ENST00000588177 K7EP34 96 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 GHRHP01286 108 aa5.89□□□□□ -1.47
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SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q6ZQY7 126 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.89□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ERC2-IT1O76042 136 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 Q8N1X5 172 aa5.88□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 H3BQ85 93 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.87□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 A0A1B0GV90 55 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 C9JAW5 83 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 H3BMG7 143 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.86□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 HSPG2P98160 4391 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 SPRR4Q96PI1 79 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 RYR1P21817 5038 aa5.85□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.84□□□□□ -1.47
SOX9-AS1-215ENST00000588177 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.84□□□□□ -1.47
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