RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 FAM229AH3BQW9 127 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 Q8N1X5 172 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 RAB37Q96AX2 223 aa7.09□□□□□ -1.27
GGA3-211ENST00000582232 BCE1O60756 84 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.08□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 C1orf137Q5JT78 98 aa7.07□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 H0Y9J4 135 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 IGLV7-43P04211 117 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 Q5VSD8 79 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 DIRC1Q969H9 104 aa7.05□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 B5MCH6 92 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 C6orf99Q4VX62 202 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.04□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 K7ERJ3 54 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 ZNF861PO60384 105 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.03□□□□□ -1.28
GGA3-211ENST00000582232 UBE2AP49459 152 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZRX8 168 aa7.02□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 H7C2G1 150 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 COX7BP24311 80 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.01□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 TSPAN13O95857 204 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 INAFM2P0DMQ5 153 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 PRLHP81277 87 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 VAMP3Q15836 100 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 BATFQ16520 125 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 Q1RN00 199 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 SPINK6Q6UWN8 80 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 Q9BRP9 147 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 H0YGX0 51 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 TRIAP1O43715 76 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-211ENST00000582232 COX6CP09669 75 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 LINC00575Q6W349 94 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.96□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 TAX1BP3O14907 124 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 PSMB2P49721 201 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.95□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 A0A1B0GX51 115 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 ERC2-IT1O76042 136 aa6.94□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 C9orf118A6NHY6 69 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A20O43772 301 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 hADV29S1A0JD25 119 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 SNCGO76070 127 aa6.91□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.91□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 SPRR4Q96PI1 79 aa6.91□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 H3BUT2 72 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.9□□□□□ -1.3
GGA3-211ENST00000582232 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 HERC1Q15751 4861 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 LINC00483Q53H64 154 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 CLEC2BQ92478 149 aa6.89□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 A0A1W2PPM0 123 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 LST1O00453 97 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 SPRR1BP22528 89 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.88□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 TRACP01848 142 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZQY7 126 aa6.87□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 TCL1BO95988 128 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 MYCBP2O75592 4640 aa6.86□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 GHRHP01286 108 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 FABP2P12104 132 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 ATXN8Q156A1 80 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 LINC01600Q96MT4 127 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 DNAL4O96015 105 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 OXTP01178 125 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 Q8N377 158 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-211ENST00000582232 H3BQ85 93 aa6.83□□□□□ -1.32
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