RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 COPS9Q8WXC6 57 aa6.59□□□□□ -1.35
TOP3A-210ENST00000580713 A0A096LNI7 61 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 M0R143 59 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 PTTG1IPP53801 180 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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TOP3A-210ENST00000580713 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 FXYD2P54710 66 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.56□□□□□ -1.36
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TOP3A-210ENST00000580713 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE2BQ13066 116 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 BATFQ16520 125 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-210ENST00000580713 A4D1N5 150 aa6.54□□□□□ -1.36
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TOP3A-210ENST00000580713 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 NDUFC2O95298 119 aa6.51□□□□□ -1.37
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TOP3A-210ENST00000580713 C1orf137Q5JT78 98 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 RAB37Q96AX2 223 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 A0A0B4J2C4 111 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GWB2 263 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 Q8NDZ9 215 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 DIRC1Q969H9 104 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 K7ERJ3 54 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 NCR3O14931 201 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV2D-28P01615 120 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 VPREB1P12018 145 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 FAM168BA1KXE4 195 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-210ENST00000580713 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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TOP3A-210ENST00000580713 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
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TOP3A-210ENST00000580713 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.46□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.46□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.45□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 C22orf24Q9Y442 160 aa6.45□□□□□ -1.38
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TOP3A-210ENST00000580713 IGLV7-43P04211 117 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 Q1RN00 199 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM126AQ9H061 195 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 M0QXV9 152 aa6.43□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 TAX1BP3O14907 124 aa6.43□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 TSPAN13O95857 204 aa6.43□□□□□ -1.38
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TOP3A-210ENST00000580713 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.42□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE10A6NGK3 116 aa6.42□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV6-57P01721 117 aa6.42□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00167Q96N53 147 aa6.42□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.41□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.4□□□□□ -1.38
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 H3BUT2 72 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 PSMB2P49721 201 aa6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 PRYO14603 147 aa6.38□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2BP63146 152 aa6.38□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 TRIAP1O43715 76 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.37□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 COX6CP09669 75 aa6.36□□□□□ -1.39
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