RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 C22orf24Q9Y442 160 aa3.82□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 M0R143 59 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 SCXQ7RTU7 201 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 RAB37Q96AX2 223 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 LINC00167Q96N53 147 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.81□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 A6NDN8 102 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 M0R378 163 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 CDK2AP2O75956 126 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 NDUFC2O95298 119 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 Q6ZSA8 131 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 COPS9Q8WXC6 57 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.8□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 HSPG2P98160 4391 aa3.79□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 A0A0B4J2C4 111 aa3.79□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 UBE2BP63146 152 aa3.79□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.79□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 XGP55808 180 aa3.78□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 Q1RN00 199 aa3.78□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.78□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.78□□□□□ -1.8
GINS3-210ENST00000568468 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 A0A1B0GWB2 263 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 EPM2AB3EWF7 344 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TSPAN13O95857 204 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 IGLV6-57P01721 117 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 HERC2O95714 4834 aa3.76□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TAX1BP3O14907 124 aa3.76□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TMEM126AQ9H061 195 aa3.76□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 H3BUT2 72 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 PRYO14603 147 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 TRIAP1O43715 76 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 PSMB2P49721 201 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 C6orf99Q4VX62 202 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 REG3GQ6UW15 175 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.75□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 PRLHP81277 87 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 C1orf137Q5JT78 98 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 DIRC1Q969H9 104 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 COX7BP24311 80 aa3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 UBE2AP49459 152 aa3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 CLEC2BQ92478 149 aa3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.73□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 BCE1O60756 84 aa3.72□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.72□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 SPRR1AP35321 89 aa3.72□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 RYR1P21817 5038 aa3.72□□□□□ -1.81
GINS3-210ENST00000568468 A0A1W2PPM0 123 aa3.71□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 ERC2-IT1O76042 136 aa3.71□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 Q9BRP9 147 aa3.71□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.71□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 FAT1Q14517 4588 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 TCL1BO95988 128 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 IGLV7-43P04211 117 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 LINC00575Q6W349 94 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 A0A1B0GV90 55 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 FABP2P12104 132 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 VAMP3Q15836 100 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 Q5VSD8 79 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 Q6ZRX8 168 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 MTURNQ8N3F0 131 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 hADV29S1A0JD25 119 aa3.68□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 COX6CP09669 75 aa3.68□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
GINS3-210ENST00000568468 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.2 ms