RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	VAMP3	Q15836	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	PRY	O14603	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	CRYGA	P11844	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.71	□□□□□ -1.65
PSEN1-222	ENST00000557356	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	NCR3	O14931	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZVH6	145 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	DAND5	Q8N907	189 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	IFITM1	P13164	125 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	SPRR1A	P35321	89 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	XP32	Q5T750	250 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		Q8NDZ9	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	FAT1	Q14517	4588 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		K7EP34	96 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	PRLH	P81277	87 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	CEND1	Q8N111	149 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A1W2PPM0	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		K7ERU9	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	FABP2	P12104	132 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	LITAF	Q99732	161 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A1B0GWB2	263 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	NPC2	P61916	151 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZRX8	168 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PSEN1-222	ENST00000557356		B5MCH6	92 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		H3BUT2	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A087X002	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	FXYD2	P54710	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		F8W1H4	67 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		A4D1N5	150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	GHRH	P01286	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		J3QR89	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	TSPAN13	O95857	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	COX7B	P24311	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		Q9BRP9	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	PCP4	P48539	62 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	PRR4	Q16378	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSEN1-222	ENST00000557356		K7ERJ3	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSEN1-222	ENST00000557356	SLC25A20	O43772	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSEN1-222	ENST00000557356	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSEN1-222	ENST00000557356	SPINK1	P00995	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSEN1-222	ENST00000557356	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms