RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 LINC00587B1AMM8 73 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 TSPAN13O95857 204 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 PYY3Q5JQD4 70 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 VAMP8Q9BV40 100 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 M0R378 163 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 LCE2BO14633 110 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 CRYGAP11844 174 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 UBE2AP49459 152 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 C12orf57Q99622 126 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 BCE1O60756 84 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 TIMM17BO60830 172 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 DDTP30046 118 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 CTAG1AP78358 180 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 TMEM126AQ9H061 195 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-233ENST00000552688 COX8AP10176 69 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 TPRXLQ17RH7 258 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 SPANXCQ9NY87 97 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 A0A087X002 238 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 LCE2CQ5TA81 110 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 NDUFC2O95298 119 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 C2orf91Q6ZV80 131 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 ARL17AQ8IVW1 177 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 LINC00337Q8N6G1 96 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 HIST1H4GQ99525 98 aa4□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 A6NDN8 102 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 PRO1933Q9H354 126 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 LPAP08519 4548 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 IGLV6-57P01721 117 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 IFITM1P13164 125 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 H7C2G1 150 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 ERC2-IT1O76042 136 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 SPRR1AP35321 89 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 S100A12P80511 92 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 MUC2Q02817 5179 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-233ENST00000552688 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 DLEU1O43261 78 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 UBE2V1Q13404 147 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 C6orf99Q4VX62 202 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 Q6ZVH6 145 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 COPS9Q8WXC6 57 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 Q9BRP9 147 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 FXYD2P54710 66 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 K7ERJ3 54 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 COX7BP24311 80 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 Q6ZRX8 168 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 CEND1Q8N111 149 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 HIGD1BQ9P298 99 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 CFC1BP0CG36 223 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 CFC1P0CG37 223 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 SMIM6P0DI80 62 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 Q1RN00 199 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 RAB37Q96AX2 223 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 SPRR4Q96PI1 79 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 HSD52Q0P140 79 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
CS-233ENST00000552688 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms