RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 H0Y8G0 127 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 LINC00587B1AMM8 73 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 IGLV6-57P01721 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 NPC2P61916 151 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 UQCC3Q6UW78 93 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-227ENST00000551441 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 LIMD2Q9BT23 127 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 H7C2G1 150 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 LEPROTO15243 131 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-227ENST00000551441 RHEBQ15382 184 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 COMMD7Q86VX2 200 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 J3QQQ9 107 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 NDUFC2O95298 119 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 IFITM2Q01629 132 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 Q1RN00 199 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 A0A0G2JQZ4 141 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 SPRR1BP22528 89 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-227ENST00000551441 HSBP1O75506 76 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 C1orf195Q5TG92 126 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 SSPOA2VEC9 5147 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 C5orf52A6NGY3 159 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 TAL2Q16559 108 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 Q6Q795 121 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 A0A0J9YXY3 114 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 USH2AO75445 5202 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 NMUP48645 174 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 HERVK_113P61574 105 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 PRO1933Q9H354 126 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 APOC3P02656 99 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-227ENST00000551441 DPM2O94777 84 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 LEPROTL1O95214 131 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 PLNP26678 52 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 CD164Q04900 197 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 FABP4P15090 132 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 COX7BP24311 80 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 IGKCP01834 107 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 LINC00310P59036 64 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 C6orf99Q4VX62 202 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 SMIM29Q86T20 159 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 AKR1D1P51857 326 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 YPEL4Q96NS1 127 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 SERF1AO75920 110 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 SPANXCQ9NY87 97 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 Q5XG85 94 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-227ENST00000551441 LITAFQ99732 161 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 SNAPINO95295 136 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 TRGC2P03986 189 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 E9PLD3 99 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 SVBPQ8N300 66 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 PCP2Q8IVA1 136 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-227ENST00000551441 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 TCL1BO95988 128 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 NDUFA5Q16718 116 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 ZNF815PA8K554 130 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 TIMM17BO60830 172 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 CFC1P0CG37 223 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GWB2 263 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 GHRHP01286 108 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 A6NDN8 102 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-227ENST00000551441 LCE4AQ5TA78 99 aa8.26□□□□□ -1.09
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