RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 PFN2P35080 140 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00158P58513 81 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00167Q96N53 147 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.58□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM126AQ9H061 195 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.57□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A096LNJ9 63 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM223A0PJW6 202 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 DPM2O94777 84 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 NDUFC2O95298 119 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKV2D-28P01615 120 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 VPREB1P12018 145 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 PRR4Q16378 134 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 CBLN2Q8IUK8 224 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LEPROTO15243 131 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SPINK1P00995 79 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 UBE2V1Q13404 147 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.55□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF213Q63HN8 5207 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 C20orf202A1L168 122 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 J3QQQ9 107 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 IGKCP01834 107 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 PMCHL1Q16048 86 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 Q6ZVH6 145 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00518Q8N0U6 118 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 PRAC1Q96KF2 57 aa2.54□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A0J9YXY3 114 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 TIMM17BO60830 172 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 TRGC2P03986 189 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SMIM13P0DJ93 91 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 DDTP30046 118 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SPRR1AP35321 89 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 TPRXLQ17RH7 258 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 YPEL4Q96NS1 127 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.53□□□□□ -2
PTPRQ-204ENST00000549355 LRP2P98164 4655 aa2.53□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 A4D1N5 150 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 E9PLD3 99 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 H0Y8G0 127 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SERF1AO75920 110 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 PRLHP81277 87 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 PET117Q6UWS5 81 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 Q6ZRX8 168 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SPRR4Q96PI1 79 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SPANXCQ9NY87 97 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TNXBP22105 4242 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM238C9JI98 176 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC25A20O43772 301 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SNCGO76070 127 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TSPAN13O95857 204 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLV6-57P01721 117 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 IFITM1P13164 125 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00483Q53H64 154 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 LIMD2Q9BT23 127 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A0U1RRA0 63 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 COLCA2A8K830 154 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRQ-204ENST00000549355 FABP4P15090 132 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms