RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0G2JQZ4 141 aa6.1□□□□□ -1.43
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PTPRB-204ENST00000538708 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 SPINK7P58062 85 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00483Q53H64 154 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 Q8NDZ9 215 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GU33 70 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 SPRR1BP22528 89 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-204ENST00000538708 R4GN34 69 aa5.65□□□□□ -1.5
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