RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 C3orf84H3BNL1 204 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-215ENST00000537304 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-215ENST00000537304 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.16□□□□□ -1.26
LMO3-215ENST00000537304 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LMO3-215ENST00000537304 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.15□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 Q8NBF4 154 aa7.14□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.13□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZRP5 223 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 Q8N377 158 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 SPRR4Q96PI1 79 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 ACANP16112 2415 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 H3BPC8 53 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 MP68P56378 58 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 C1orf137Q5JT78 98 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.12□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 HCG22E2RYF7 251 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 AKAP9Q99996 3911 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 H3BNG1 76 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 UBE2BP63146 152 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 SMR3AQ99954 134 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PNM2 257 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 PSCAO43653 123 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 TNP2Q05952 138 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZRX8 168 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 LIMD2Q9BT23 127 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-215ENST00000537304 UBE2AP49459 152 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 CD164Q04900 197 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 DEFB135Q30KP9 77 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 Q8NAQ8 132 aa7.07□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 DSCR10P59022 87 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 SYCNQ0VAF6 134 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 HTN3P15516 51 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 C15orf56Q8N910 161 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 C7orf33Q8WU49 177 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 B9D2Q9BPU9 175 aa7.06□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 PSPHP1O15172 72 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 Q9BRP9 147 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 HIVEP2P31629 2446 aa7.05□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 MTORP42345 2549 aa7.04□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 K7EQZ3 153 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 SPRR1AP35321 89 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 DEFB4AO15263 64 aa7.03□□□□□ -1.28
LMO3-215ENST00000537304 NOTCH2Q04721 2471 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.02□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 INAFM1C9JVW0 142 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 LINC00208Q96KT6 92 aa7.01□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 A8MUN3 132 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 NF1P21359 2839 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 Q5VV11 94 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 NDUFS5O43920 106 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP10-3P60369 221 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-215ENST00000537304 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 H0Y9P7 68 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 JMJD1CQ15652 2540 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 Q75L30 129 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 PRR4Q16378 134 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 HIVEP1P15822 2718 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 CUBNO60494 3623 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 REG3GQ6UW15 175 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 CASC2Q6XLA1 102 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 PRR15LQ9BU68 103 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-215ENST00000537304 IGFL1Q6UW32 110 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms