RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 PRYO14603 147 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 AKR1D1P51857 326 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 DDTP30046 118 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP10-8P60410 259 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 TIMM17BO60830 172 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 SCGB1D1O95968 90 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFC2O95298 119 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 CRYGAP11844 174 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 PCP2Q8IVA1 136 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 LITAFQ99732 161 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.84□□□□□ -1.31
UBASH3B-208ENST00000533451 SPANXCQ9NY87 97 aa6.83□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A087X002 238 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 B5MCH6 92 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 COPS9Q8WXC6 57 aa6.81□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 C9orf118A6NHY6 69 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV6-57P01721 117 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 C5orf52A6NGY3 159 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPAN13O95857 204 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SPRR1AP35321 89 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
UBASH3B-208ENST00000533451 IFITM1P13164 125 aa6.77□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6ZRX8 168 aa6.77□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.77□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 SPRR4Q96PI1 79 aa6.77□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 TNXBP22105 4242 aa6.77□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 A6NDN8 102 aa6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 Q6ZVH6 145 aa6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 ERC2-IT1O76042 136 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 Q9BRP9 147 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR4Q16378 134 aa6.73□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 COX7BP24311 80 aa6.72□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 C6orf99Q4VX62 202 aa6.72□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 VAMP8Q9BV40 100 aa6.72□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.72□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.72□□□□□ -1.33
UBASH3B-208ENST00000533451 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 SPATA45Q537H7 98 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 HIST1H4GQ99525 98 aa6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.7□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 COX8AP10176 69 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 MOBPQ13875 183 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 C14orf144Q96I85 54 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 C12orf57Q99622 126 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 A4D1N5 150 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC00483Q53H64 154 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 Q8NBF4 154 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GWB2 263 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 TAL2Q16559 108 aa6.65□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.65□□□□□ -1.34
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 DLEU1O43261 78 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 VAMP3Q15836 100 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 H7C2G1 150 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC25A20O43772 301 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms