RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.2□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 IGLV6-57P01721 117 aa9.19□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.19□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.18□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 IFITM1P13164 125 aa9.18□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 Q6ZVH6 145 aa9.18□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.18□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.17□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.17□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.16□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A087X002 238 aa9.15□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 B5MCH6 92 aa9.15□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.15□□□□□ -0.94
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.13□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.13□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 LPAP08519 4548 aa9.13□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 Q6ZRX8 168 aa9.12□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 SPRR4Q96PI1 79 aa9.12□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 A6NDN8 102 aa9.09□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.09□□□□□ -0.95
TSNARE1-206ENST00000520462 Q9BRP9 147 aa9.08□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 COX8AP10176 69 aa9.07□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.07□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 VAMP8Q9BV40 100 aa9.07□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.06□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 ERC2-IT1O76042 136 aa9.06□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 TSPAN13O95857 204 aa9.06□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.06□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 COX7BP24311 80 aa9.05□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 C6orf99Q4VX62 202 aa9.05□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA45Q537H7 98 aa9.05□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.05□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.05□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 DLEU1O43261 78 aa9.04□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 HIST1H4GQ99525 98 aa9.04□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.04□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 C14orf144Q96I85 54 aa9.03□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.03□□□□□ -0.96
TSNARE1-206ENST00000520462 LINC00483Q53H64 154 aa9.02□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 A4D1N5 150 aa9.01□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 C4orf48Q5BLP8 95 aa9□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.99□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A1B0GWB2 263 aa8.99□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.99□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 PRR4Q16378 134 aa8.98□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.98□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 MOBPQ13875 183 aa8.97□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.97□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 HIGD1BQ9P298 99 aa8.97□□□□□ -0.97
TSNARE1-206ENST00000520462 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.96□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 CTAG1AP78358 180 aa8.96□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 VAMP3Q15836 100 aa8.96□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 Q8NBF4 154 aa8.96□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 TAL2Q16559 108 aa8.95□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 PYY3Q5JQD4 70 aa8.95□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.95□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 C12orf57Q99622 126 aa8.95□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 MUC2Q02817 5179 aa8.94□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.94□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC25A20O43772 301 aa8.93□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.92□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.92□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.92□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 SPRR1BP22528 89 aa8.91□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 RAB37Q96AX2 223 aa8.91□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.9□□□□□ -0.98
TSNARE1-206ENST00000520462 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.89□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 SPINK1P00995 79 aa8.89□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.89□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.88□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 A6NJY4 79 aa8.88□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 H7C2G1 150 aa8.88□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 CFC1BP0CG36 223 aa8.87□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 CFC1P0CG37 223 aa8.87□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.87□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 CEND1Q8N111 149 aa8.87□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A0B4J2C4 111 aa8.86□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 Q1RN00 199 aa8.86□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 LINC00575Q6W349 94 aa8.85□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.84□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 hADV29S1A0JD25 119 aa8.84□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.84□□□□□ -0.99
TSNARE1-206ENST00000520462 HSD52Q0P140 79 aa8.83□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.81□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A0U1RQV1 116 aa8.81□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 SNCGO76070 127 aa8.81□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 FXYD2P54710 66 aa8.81□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
TSNARE1-206ENST00000520462 Q6ZQY7 126 aa8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.5 ms