RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 PRO0461Q9UI25 63 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 TRIAP1O43715 76 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV6-57P01721 117 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 M0R378 163 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 PSMB2P49721 201 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 MTURNQ8N3F0 131 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 SCXQ7RTU7 201 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM126AQ9H061 195 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 C6orf99Q4VX62 202 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC2BQ92478 149 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZSA8 131 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 UBE2BP63146 152 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 SCGB1C2P0DMR2 95 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 CDIP1Q9H305 208 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 FAT1Q14517 4588 aa9.65□□□□□ -0.86
TRPS1-206ENST00000517323 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 TCL1BO95988 128 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 EPM2AB3EWF7 344 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 PRLHP81277 87 aa9.62□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 XGP55808 180 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 DIRC1Q969H9 104 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 REG3GQ6UW15 175 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 TEN1Q86WV5 123 aa9.61□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 MT-ATP8P03928 68 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-206ENST00000517323 HSPG2P98160 4391 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 PRYO14603 147 aa9.58□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 SPRR1AP35321 89 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 Q9BRP9 147 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 COX6CP09669 75 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 COX7BP24311 80 aa9.57□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 B5MCH6 92 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 C1orf137Q5JT78 98 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ERC2-IT1O76042 136 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZRX8 168 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 LST1O00453 97 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00575Q6W349 94 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 RYR1P21817 5038 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 H0YGX0 51 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 BCE1O60756 84 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 ATXN8Q156A1 80 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 C9JAW5 83 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 UBE2AP49459 152 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 hADV29S1A0JD25 119 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZQY7 126 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 SLC25A20O43772 301 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.48□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.47□□□□□ -0.89
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01600Q96MT4 127 aa9.46□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 SNCGO76070 127 aa9.45□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 DNAL4O96015 105 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV7-43P04211 117 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 Q6Q795 121 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.44□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 TRACP01848 142 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.43□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.41□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF861PO60384 105 aa9.4□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.4□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 H0Y9J4 135 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms