RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514702.1

HOXC-AS3-203, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 368 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IFITM2Q01629 132 aa6.9□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LEPROTO15243 131 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NDUFC2O95298 119 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NPC2P61916 151 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 H7C2G1 150 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 J3QQQ9 107 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HERVK_113P61574 105 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HSBP1O75506 76 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SPRR1BP22528 89 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NMUP48645 174 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PLNP26678 52 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CD164Q04900 197 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PRO1933Q9H354 126 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TAL2Q16559 108 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 Q1RN00 199 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 Q6Q795 121 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LEPROTL1O95214 131 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DPM2O94777 84 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 COX7BP24311 80 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 AKR1D1P51857 326 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 C1orf195Q5TG92 126 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A0A0J9YXY3 114 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IGKCP01834 107 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 APOC3P02656 99 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SPANXCQ9NY87 97 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 Q5XG85 94 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SNAPINO95295 136 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NDUFA5Q16718 116 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 C6orf99Q4VX62 202 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SMIM29Q86T20 159 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TCL1BO95988 128 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FABP4P15090 132 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A0A0G2JQZ4 141 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SVBPQ8N300 66 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-203ENST00000514702 E9PLD3 99 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SERF1AO75920 110 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CFC1P0CG37 223 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PCP2Q8IVA1 136 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TIMM17BO60830 172 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LITAFQ99732 161 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A0A1B0GWB2 263 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TRGC2P03986 189 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 YPEL4Q96NS1 127 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 F8WEM9 126 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A6NDN8 102 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZNF815PA8K554 130 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LINC00310P59036 64 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 C20orf202A1L168 122 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A4D1N5 150 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 Q75L30 129 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 COPS9Q8WXC6 57 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-203ENST00000514702 Q96NJ1 140 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 USH2AO75445 5202 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SSPOA2VEC9 5147 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 Q6JHZ5 121 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CLEC2BQ92478 149 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IFITM1P13164 125 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 VAMP3Q15836 100 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LINC01545Q5VT33 79 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LST1O00453 97 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 IGFL1Q6UW32 110 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PET117Q6UWS5 81 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms