RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 A6NDN8 102 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 CEND1Q8N111 149 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 Q8N814 137 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.7□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 BATFQ16520 125 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.69□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 RAB37Q96AX2 223 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 NPC2P61916 151 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 WFDC2Q14508 124 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 DAND5Q8N907 189 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 DPH3Q96FX2 82 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 NDUFC2O95298 119 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-210ENST00000512194 C16orf90A8MZG2 172 aa4.65□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.65□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 A0A0B4J2C4 111 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 FXYD2P54710 66 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.64□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 M0R378 163 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 Q1RN00 199 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GWB2 263 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 TMEM126AQ9H061 195 aa4.62□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 A0A096LNI7 61 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 SNCGO76070 127 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 COX6CP09669 75 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 PSMB2P49721 201 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 H7C2G1 150 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 NCR3O14931 201 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 VAMP3Q15836 100 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 K7ERJ3 54 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 REG3GQ6UW15 175 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 C22orf24Q9Y442 160 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 M0QXV9 152 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2D-28P01615 120 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 FABP2P12104 132 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 LINC01620Q4KN68 170 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.58□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 IGLV6-57P01721 117 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 CHTF8P0CG12 524 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 UBE2BP63146 152 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PNN7 141 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 FAM168BA1KXE4 195 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 H0YGX0 51 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 H3BUT2 72 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 TAX1BP3O14907 124 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 TSPAN13O95857 204 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 C7orf33Q8WU49 177 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 DIRC1Q969H9 104 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 LINC00167Q96N53 147 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A20O43772 301 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.55□□□□□ -1.68
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