RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-211ENST00000503687 FAM168BA1KXE4 195 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf48Q96LS8 159 aa8.52□□□□□ -1.04
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RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-211ENST00000503687 IGFL1Q6UW32 110 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-211ENST00000503687 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.19□□□□□ -1.1
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