RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498666.5

ITGB2-212, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGB2, Length 4,781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-212ENST00000498666 XIRP2A4UGR9 3374 aa9□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 FAM104AQ969W3 186 aa9□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 LINC00313P59037 77 aa9□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 A0A1B0GU69 56 aa9□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 MGAQ8IWI9 3026 aa8.99□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.99□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.99□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 KLKP1Q107X0 134 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 A8MWP4 228 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 SPINK1P00995 79 aa8.98□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.97□□□□□ -0.97
ITGB2-212ENST00000498666 CENPEQ02224 2701 aa8.96□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 TRIOO75962 3097 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.95□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 FAM168BA1KXE4 195 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 C15orf56Q8N910 161 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.94□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.93□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 K7EQZ3 153 aa8.92□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 Q8N377 158 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 H7BZZ5 65 aa8.91□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 ZNF292O60281 2723 aa8.9□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 USP24Q9UPU5 2620 aa8.9□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 KRTAP10-3P60369 221 aa8.9□□□□□ -0.98
ITGB2-212ENST00000498666 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.88□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.88□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.88□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.87□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 ITPR3Q14573 2671 aa8.87□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 CHTF8P0CG12 524 aa8.86□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 ZNF861PO60384 105 aa8.86□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 K7EIL1 84 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 PRR15Q8IV56 129 aa8.85□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 IGFL1Q6UW32 110 aa8.84□□□□□ -0.99
ITGB2-212ENST00000498666 SZT2Q5T011 3432 aa8.83□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 KRTAP10-11P60412 298 aa8.82□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 ATRQ13535 2644 aa8.8□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.8□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.8□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.79□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.79□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.79□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 Q96NJ1 140 aa8.79□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 A0A087WTM6 91 aa8.79□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 A0A1B0GVX0 72 aa8.78□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 A0A1W2PNM2 257 aa8.78□□□□□ -1
ITGB2-212ENST00000498666 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 A8MUN3 132 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 FRYQ5TBA9 3013 aa8.76□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 A0A0G2JQZ4 141 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 A0A1W2PNN7 141 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.75□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 UQCR11O14957 56 aa8.74□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 LAMA1P25391 3075 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 COA5Q86WW8 74 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 AKAP13Q12802 2813 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ITGB2-212ENST00000498666 WIPF1O43516 503 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 VCANP13611 3396 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 CASC10Q5T4H9 136 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 APLNQ9ULZ1 77 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 IGLV7-43P04211 117 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 CHD6Q8TD26 2715 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 OCR1Q9BZK8 76 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 SPRR4Q96PI1 79 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 CD164Q04900 197 aa8.68□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 MAST4O15021 2626 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 Q8NDZ9 215 aa8.66□□□□□ -1.02
ITGB2-212ENST00000498666 J3QL48 77 aa8.64□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 DSCR10P59022 87 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 CR1P17927 2039 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 COL6A3P12111 3177 aa8.59□□□□□ -1.03
ITGB2-212ENST00000498666 EYSQ5T1H1 3165 aa8.58□□□□□ -1.04
ITGB2-212ENST00000498666 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB2-212ENST00000498666 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGB2-212ENST00000498666 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB2-212ENST00000498666 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms