RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSTD3	H0UI37	97 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7ERJ3	54 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAMP	P81172	84 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSD52	Q0P140	79 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX17	Q14061	63 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEND1	Q8N111	149 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKHD1	P08F94	4074 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GWB2	263 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf90	A8MZG2	172 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAL2	Q16559	108 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZSA8	131 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZVH6	145 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFITM1	P13164	125 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCR3	O14931	201 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZVQ6	151 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	C22orf24	Q9Y442	160 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	RYR1	P21817	5038 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAX1BP3	O14907	124 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFC2	O95298	119 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV6-57	P01721	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	BATF	Q16520	125 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCX	Q7RTU7	201 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0B4J2C4	111 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAT1	Q14517	4588 aa		3.78	□□□□□ -1.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0QXV9	152 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R143	59 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R378	163 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPAN13	O95857	204 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB37	Q96AX2	223 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7C2G1	150 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR1A	P35321	89 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8NBF4	154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPG2	P98160	4391 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NDN8	102 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM126A	Q9H061	195 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERC2	O95714	4834 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BUT2	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf99	Q4VX62	202 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q9BRP9	147 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GV90	55 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPM0	123 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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