RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 TSTD3H0UI37 97 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 K7ERJ3 54 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 HAMPP81172 84 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 HSD52Q0P140 79 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 COX17Q14061 63 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 CEND1Q8N111 149 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 PKHD1P08F94 4074 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1B0GWB2 263 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 C16orf90A8MZG2 172 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM238C9JI98 176 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 TAL2Q16559 108 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZSA8 131 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZVH6 145 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 HIST1H4GQ99525 98 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 IFITM1P13164 125 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 SFTA2Q6UW10 78 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 NCR3O14931 201 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 C7orf33Q8WU49 177 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 Q6ZVQ6 151 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 C22orf24Q9Y442 160 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 RYR1P21817 5038 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 TAX1BP3O14907 124 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 NDUFC2O95298 119 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLV6-57P01721 117 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 BATFQ16520 125 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 SCXQ7RTU7 201 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00167Q96N53 147 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A0B4J2C4 111 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 NDUFAF8A1L188 74 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 FAT1Q14517 4588 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-212ENST00000491266 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 M0QXV9 152 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 M0R143 59 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 M0R378 163 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 TSPAN13O95857 204 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 RAB37Q96AX2 223 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 H7C2G1 150 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRR1AP35321 89 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 Q8NBF4 154 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 HSPG2P98160 4391 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 A6NDN8 102 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 ERC2-IT1O76042 136 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 DPH3Q96FX2 82 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM126AQ9H061 195 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 HERC2O95714 4834 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 H3BUT2 72 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 C6orf99Q4VX62 202 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 COPS9Q8WXC6 57 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 CLEC2BQ92478 149 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 Q9BRP9 147 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-212ENST00000491266 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-212ENST00000491266 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-212ENST00000491266 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1B0GV90 55 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1W2PPM0 123 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms