RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 TSC22D3Q99576 134 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 CRIPTQ9P021 101 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 NUP188Q5SRE5 1749 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-1.24□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 SMARCA2P51531 1590 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 A0A0G2JMZ2 1700 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 TNP1P09430 55 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 C1orf54Q8WWF1 131 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 LCN9Q8WX39 176 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 ADGRL2O95490 1459 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-1.25□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 ALKQ9UM73 1620 aa-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 FDCSPQ8NFU4 85 aa-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 FAM107BQ9H098 131 aa-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 NALCNQ8IZF0 1738 aa-1.26□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-1.27□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 COX8AP10176 69 aa-1.27□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB136Q30KP8 78 aa-1.27□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.27□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.28□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 GNG11P61952 73 aa-1.28□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 USMG5Q96IX5 58 aa-1.28□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 PRO1933Q9H354 126 aa-1.28□□□□□ -2.61
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 MRC2Q9UBG0 1479 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 H7BZZ5 65 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 HMGN1P05114 100 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 Q0VG73 95 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.29□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 SCAPERQ9BY12 1400 aa-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 LINC01546A6NGU7 62 aa-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 TOP2BQ02880 1626 aa-1.3□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 MYOM2P54296 1465 aa-1.31□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 BRCA2P51587 3418 aa-1.31□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 F6UZH7 168 aa-1.31□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.31□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 PLXNC1O60486 1568 aa-1.31□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-1.31□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.32□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 A8MTW9 85 aa-1.32□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.32□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.32□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 WIZO95785 1651 aa-1.32□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1B0GWA3 101 aa-1.33□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 FAM24AA6NFZ4 105 aa-1.33□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 COX6CP09669 75 aa-1.33□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 LEAP2Q969E1 77 aa-1.33□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-1.33□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 CDH23Q9H251 3354 aa-1.33□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 CUX1P39880 1505 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 C4AP0C0L4 1744 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 C4BP0C0L5 1744 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 CROCC2H7BZ55 1655 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 NLRP1Q9C000 1473 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.34□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1.35□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.35□□□□□ -2.62
ITGA4-211ENST00000490435 M0QZ58 72 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 NDUFA3O95167 84 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 TRAPPC2P0DI81 140 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 PRO1854Q9UHT4 67 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ATP7BP35670 1465 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 KIF21BO75037 1637 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 CCL22O00626 93 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 SNAPC5O75971 98 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 SEC11AP67812 179 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-1.36□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 MED14O60244 1454 aa-1.37□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 LY75O60449 1722 aa-1.37□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.37□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 I3L3M4 83 aa-1.37□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.37□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.37□□□□□ -2.63
ITGA4-211ENST00000490435 XIRP2A4UGR9 3374 aa-1.38□□□□□ -2.63
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