RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490104.5

TSN-208, Transcript of translin, humanhuman

TSL 2

Gene TSN, Length 2,717 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSN-208ENST00000490104 K7EP34 96 aa8.77□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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TSN-208ENST00000490104 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.77□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 COX6CP09669 75 aa8.77□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 A0A1B0GV72 72 aa8.75□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.74□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 UBE2V1Q13404 147 aa8.74□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 DIRC1Q969H9 104 aa8.73□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 C9JAW5 83 aa8.73□□□□□ -1.01
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TSN-208ENST00000490104 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.73□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.72□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.72□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 SCXQ7RTU7 201 aa8.72□□□□□ -1.01
TSN-208ENST00000490104 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.7□□□□□ -1.02
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TSN-208ENST00000490104 LST1O00453 97 aa8.7□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.7□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.69□□□□□ -1.02
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TSN-208ENST00000490104 FAT1Q14517 4588 aa8.68□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.68□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 COX7BP24311 80 aa8.68□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.68□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.68□□□□□ -1.02
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TSN-208ENST00000490104 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.67□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.67□□□□□ -1.02
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TSN-208ENST00000490104 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.66□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 Q9BRP9 147 aa8.66□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 LINC00575Q6W349 94 aa8.65□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 Q6ZQY7 126 aa8.65□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.65□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.65□□□□□ -1.02
TSN-208ENST00000490104 H0YGX0 51 aa8.65□□□□□ -1.03
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TSN-208ENST00000490104 SLC25A20O43772 301 aa8.64□□□□□ -1.03
TSN-208ENST00000490104 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.64□□□□□ -1.03
TSN-208ENST00000490104 PRYO14603 147 aa8.64□□□□□ -1.03
TSN-208ENST00000490104 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.64□□□□□ -1.03
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TSN-208ENST00000490104 B5MCH6 92 aa8.63□□□□□ -1.03
TSN-208ENST00000490104 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TSN-208ENST00000490104 ETDBQ3ZM63 59 aa8.63□□□□□ -1.03
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TSN-208ENST00000490104 TRACP01848 142 aa8.59□□□□□ -1.03
TSN-208ENST00000490104 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.59□□□□□ -1.03
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TSN-208ENST00000490104 XGP55808 180 aa8.56□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.56□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 BCE1O60756 84 aa8.55□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.54□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.53□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 SNCGO76070 127 aa8.53□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.52□□□□□ -1.04
TSN-208ENST00000490104 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.52□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 HSPG2P98160 4391 aa8.52□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.52□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 A0A0G2JQZ4 141 aa8.51□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 H3BT86 120 aa8.5□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 Q8N377 158 aa8.5□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.5□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 TEN1Q86WV5 123 aa8.49□□□□□ -1.05
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TSN-208ENST00000490104 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 A0A1B0GX51 115 aa8.48□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 IGLV7-43P04211 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TSN-208ENST00000490104 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.47□□□□□ -1.05
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TSN-208ENST00000490104 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.45□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 RYR1P21817 5038 aa8.45□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 VPS25Q9BRG1 176 aa8.44□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.43□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.42□□□□□ -1.06
TSN-208ENST00000490104 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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