RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 NMUP48645 174 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 SFTA2Q6UW10 78 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 B5MCH6 92 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 TIMM17BO60830 172 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 DDTP30046 118 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 UBE2AP49459 152 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 RNF213Q63HN8 5207 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 PRYO14603 147 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 NDUFC2O95298 119 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 S100A2P29034 98 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 SPRR4Q96PI1 79 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 SPANXCQ9NY87 97 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 S100A6P06703 90 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 TSPAN13O95857 204 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 SCGB1D1O95968 90 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 PYY3Q5JQD4 70 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 C14orf144Q96I85 54 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 C20orf202A1L168 122 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00587B1AMM8 73 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZRX8 168 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 MUC17Q685J3 4493 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 COX8AP10176 69 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00483Q53H64 154 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 C12orf57Q99622 126 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 MUC2Q02817 5179 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0G2JQZ4 141 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 A4D1N5 150 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 CRYGAP11844 174 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 SPATA45Q537H7 98 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 C6orf99Q4VX62 202 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 AKR1D1P51857 326 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 Q8NBF4 154 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 IFITM1P13164 125 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 MOBPQ13875 183 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 SMIM29Q86T20 159 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 A6NDN8 102 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 DLEU1O43261 78 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 CFC1BP0CG36 223 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 CFC1P0CG37 223 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 COX7BP24311 80 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 FXYD2P54710 66 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZVH6 145 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 VAMP8Q9BV40 100 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 SPRR1BP22528 89 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 PRR4Q16378 134 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 Q8N377 158 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 HIST1H4GQ99525 98 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 CDIP1Q9H305 208 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 K7ERJ3 54 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 Q1RN00 199 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 HIGD1BQ9P298 99 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 H7C2G1 150 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00575Q6W349 94 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 CEND1Q8N111 149 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms