RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 GAGE10A6NGK3 116 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-211ENST00000488243 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 REG3GQ6UW15 175 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 SPRR1AP35321 89 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 H0Y9J4 135 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 VAMP3Q15836 100 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 DIRC1Q969H9 104 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 BCE1O60756 84 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 BATFQ16520 125 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 Q1RN00 199 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 COX6CP09669 75 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NISCH-211ENST00000488243 H0YGX0 51 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 SNCGO76070 127 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 C6orf99Q4VX62 202 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 C1orf137Q5JT78 98 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 H7C2G1 150 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 K7ERJ3 54 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN13O95857 204 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 IGLV7-43P04211 117 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 COX7BP24311 80 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 B5MCH6 92 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 ZNF861PO60384 105 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 UBE2AP49459 152 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 PSMB2P49721 201 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 Q6ZRX8 168 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GX51 115 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.18□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A20O43772 301 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 TRIAP1O43715 76 aa7.16□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 C9orf118A6NHY6 69 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 TAX1BP3O14907 124 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.15□□□□□ -1.26
NISCH-211ENST00000488243 GHRHP01286 108 aa7.14□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.14□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 LINC00575Q6W349 94 aa7.14□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 RNF213Q63HN8 5207 aa7.14□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.13□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 hADV29S1A0JD25 119 aa7.13□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 PRLHP81277 87 aa7.13□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 Q9BRP9 147 aa7.12□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 H3BQ85 93 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 H3BUT2 72 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PPM0 123 aa7.1□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 TRACP01848 142 aa7.1□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 FABP2P12104 132 aa7.1□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 LST1O00453 97 aa7.09□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 ATXN8Q156A1 80 aa7.09□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.09□□□□□ -1.27
NISCH-211ENST00000488243 DNAL4O96015 105 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 OXTP01178 125 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 CLEC2BQ92478 149 aa7.06□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.06□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.06□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 LRP2P98164 4655 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 ERC2-IT1O76042 136 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 SPRR1BP22528 89 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 SPRR4Q96PI1 79 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 TCL1BO95988 128 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-211ENST00000488243 LINC00483Q53H64 154 aa7.04□□□□□ -1.28
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