RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 PDE6GP18545 87 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 SEC61GP60059 68 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 UBE2AP49459 152 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 AKAP9Q99996 3911 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFB1O75438 58 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 NUPR2A6NF83 97 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 COX17Q14061 63 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 PRO0628Q9UI54 55 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFC1O43677 76 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 LITAFQ99732 161 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 Q8N814 137 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM104AQ969W3 186 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00208Q96KT6 92 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 M0R378 163 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 C14orf177Q52M58 125 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 CRYGAP11844 174 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 PRR15LQ9BU68 103 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZVQ6 151 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 PRYO14603 147 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 H3BNG1 76 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 B9D2Q9BPU9 175 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00575Q6W349 94 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 CASC10Q5T4H9 136 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 TENM3Q9P273 2699 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 PCOTHQ58A44 107 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 KIAA0087Q14695 138 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 C2orf48Q96LS8 159 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 CHTF8P0CG12 524 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 PRR34Q9NV39 138 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZRP5 223 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 WIPF1O43516 503 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 PRLHP81277 87 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 H3BQ85 93 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM168BA1KXE4 195 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 C22orf24Q9Y442 160 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 MUC7Q8TAX7 377 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 C7orf33Q8WU49 177 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRVP-201ENST00000482597 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf137Q5JT78 98 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 C15orf56Q8N910 161 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00167Q96N53 147 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 SMIM29Q86T20 159 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 REG3GQ6UW15 175 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A087WSZ3 146 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 CASC2Q6XLA1 102 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 VPREB1P12018 145 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRVP-201ENST00000482597 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 APLNQ9ULZ1 77 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 A8MUN3 132 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 H0Y9P7 68 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 TENM2Q9NT68 2774 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 SPINK1P00995 79 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 RTL8CO15255 209 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 F8WDY8 70 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 IGLV6-57P01721 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 Q8NDZ9 215 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6ZQT0 140 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf90A8MZG2 172 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRVP-201ENST00000482597 CXCL6P80162 114 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms