RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 RGPD2P0DJD1 1756 aa0.22□□□□□ -2.37
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PTPRG-202ENST00000468576 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP0.19□□□□□ -2.383e-7■■■■□ 23.8
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PTPRG-202ENST00000468576 BSNQ9UPA5 3926 aa0.19□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 EYSQ5T1H1 3165 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 RELNP78509 3460 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 COL7A1Q02388 2944 aa0.18□□□□□ -2.38
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